Caractérisation de facteurs impliqués dans la voie majeure de dégradation 5' vers 3' des ARNm cytoplasmiques chez Saccharomyces cerevisiae

par Kenza Zemam

Thèse de doctorat en Microbiologie

Sous la direction de Alain Jacquier.

Soutenue en 2008

à Paris 7 .


  • Résumé

    Chez les eucaryotes, l'expression des genes peut etre regulee au niveau post-transcriptionnel, à des étapes comme la traduction et la dégradation des arnm. Chez la levure saccharomyces cerevisiae, ces processus se chevauchent et entrent en compétition. Les p-bodies. Qui sont des structures intracellulaires dont la taille et le nombre augmentent sous des conditions variées de stress, contiennent des arnm non traduits ainsi que de nombreux facteurs impliqués dans la répression de la traduction et la dégradation des arnm. Edc3, un des composants de ces foyers, a été montré comme impliqué dans des mécanismes de décoiffage de cibles spécifiques. Dans une première partie de mon travail, j'ai étudié l'implication de edc3 dans des mécanismes de régulation de la traduction pour l'adaptation cellulaire en condition de carence en glucose. Je n'ai pas trouvé de cibles spécifiques à edc3 sous ces conditions. Cependant, j'ai identifié un arnm dont l'inhibition de la traduction serait régulée par edc3 dans toutes les conditions testées. Pour mieux comprendre la fonction de edc3, j'ai utilisé dans un second temps des résultats de cribles génétiques effectués au laboratoire et j'ai identifié ses partenaires fonctionnels. Une des délétions de gène qui donnent un effet synthétique de ralentissement de croissance avec edcs(delta), est scd6 (delta). En réalisant des tests fonctionnels j'ai pu montrer que edc3 et scd6 ont une fonction redondante au niveau de la dégradation 5' vers 3' des arnm. Ces résultats montrent que même si edc3 n'est pas une protéine essentielle, elle partage avec scd6 une fonction importante pour la dégradation 5' vers 3'. Des arnm.

  • Titre traduit

    Characterization of factors involved in the major 5'to 3' degradation pathway of cytoplasmic MRNA in the budding yeast saccharomyces cerevisiae


  • Résumé

    In eukaryotic cells, gene expression can be modulated at several post-transcriptional steps including mrna translation and degradation. In the budding yeast saccharomyces cerevisiae, these processes are intertwined and compete with each other. P-bodies, intracellular structures that increase in size and number under various stress conditions, contain translationnally repressed mrnas and proteins invovled in translation repression and mrna degradation. One of the conserved components of the p-bodies, edc3, was shown to be involved in specific mrna decapping mechanisms. As a first part of my work, i studied the involvement of edc3 in mrna translation regulation mechanisms that are specific to cellular adaptation to starvation (glucose removal from the medium). I could not identify specific targets for edc3 under these conditions. Yet, i identified one mrna which translation appears repressed by a mechanism involving edc3, under all conditions studied. To better understand the biological function of edc3, i identified its functional partners based on the results of a genome wide genetic screen. One of the gene deletions that was synthetic slow growth with the edcs(delta) mutation was scd6(delta). By performing functional analysis, i could show that, while edc3 is not an essential protein, it shares with scd6 an important function for 5' to 3' mrna degradation. Formtext

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Informations

  • Détails : 1 vol. (223 f.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : 112 réf.

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  • Bibliothèque : Université Paris Diderot - Paris 7. Service commun de la documentation. Bibliothèque Universitaire des Grands Moulins.
  • PEB soumis à condition
  • Cote : TS (2008) 074
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