Développement de marqueurs moléculaires liés à la résistance à la mortalité estivale chez l'huître creuse Crassostrea gigas - approche QTL

par Christopher Sauvage

Thèse de doctorat en Biologie

Sous la direction de Pierre Boudry.

Soutenue en 2008

à La Rochelle .


  • Résumé

    L’huître du Pacifique Crassostrea gigas est la principale espèce aquatique produite dans le monde (4,2 millions de tonnes pour un chiffre d'affaire de 3,5 milliards de dollars US selon la FAO, 2005). Cependant, depuis plus de 15 ans, les élevages subissent des épisodes de mortalité estivale (30%-60%) qui peuvent à terme mettre en péril la compétitivité de l’aquaculture européenne de mollusques. Hormis l’importance économique de C. Gigas, qui justifie un effort de recherche, les huîtres constituent un modèle d’étude des bases physiologiques et génétiques de caractères complexes (ie croissance, reproduction et survie) fortement corrélés avec la réponse des huîtres à différentes conditions environnementales. Une des solutions envisagées est la sélection d’individus plus résistants à la mortalité. Compte tenu des contraintes liées à la mise en place de tels schémas de sélection, le développement de marqueurs génétiques, permettant une sélection assistée par ces mêmes marqueurs, apparaît aujourd’hui comme une voie de recherche intéressante. Réalisé dans le cadre du projet européen « Aquafirst » (FP6), ce sujet de doctorat a pour but de développer une cartographie permettant la détection des relations génotype - phénotype par une approche QTL (Quantitative Trait Locus). Le trait de phénotype considéré est la mortalité estivale. Pour cela, de nouveaux marqueurs moléculaires de type SNP (Single Nucleotide Polymorphism) ont été développés pour établir une carte génétique à l’aide de l’ensemble des marqueurs disponibles (microsatellites et SNP). Ces travaux ont été menés sur des individus issus de familles d’huîtres consanguines présentant des performances contrastées en terme de survie estivale, obtenus lors du programme MOREST.

  • Titre traduit

    Development of molecular markers associated with resistance to summer kill the Pacific oyster Crassostrea gigas - a QTL approach


  • Résumé

    The Pacific oyster Crassostrea gigas is the main aquatic species produced in the world (4. 2 million tons / 3. 5 billion dollars, FAO, 2005). However, for over 15 years, farms suffer episodes of summer mortality (30% -60%), which may ultimately jeopardize the competitiveness of European aquaculture shellfish. Apart from the economic importance of C. Gigas, which justifies a research effort, oysters are a model for studying the genetic and physiological bases of complex characters (ie growth, reproduction and survival) strongly correlated with the response of the oysters to different environmental conditions. One option being considered is the selection of individuals more resistant to death. Given the constraints associated with the introduction of such schemes selection, the development of genetic markers, allowing assisted selection by the same markers, emerged as an interesting avenue of research. Produced as part of the European project "Aquafirst (FP6), the subject of this PhD aims to develop a map to detect relationships genotype - phenotype by a QTL approach (Quantitative Trait Locus). The phenotype trait is considered mortality summer. To achieve this, new molecular markers of type SNP (Single Nucleotide Polymorphism) have been developed to establish a genetic map with all the markers available (SNP and microsatellite). This work was conducted on individuals from families of consanguineous oysters presenting contrasted performances in terms of survival during summer achieved in the program MOREST.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (269 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. p. 221-252. Index

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