Recalage et Mosaïques d’Images pour la Microscopie Confocale Fibrée Dynamique In Vivo

par Tom Vercauteren

Thèse de doctorat en Informatique temps réel, robotique et informatique

Sous la direction de Nicholas Ayache.

Soutenue en 2008

à Paris, ENMP .

  • Titre traduit

    Image Registration and Mosaicing for Dynamic In Vivo Fibered Confocal Microscopy


  • Pas de résumé disponible.


  • Résumé

    La microscopie confocale peut être adaptée in vivo grâce à l’utilisation de fibres optiques et devrait permettre à terme de réaliser des biopsies optiques. Le but de cette thèse est de dépasser les limites matérielles de ces instruments grâce au recalage d’images. Ce manuscrit est cadré par l’objectif de proposer, au travers de mosaïques d’images, des biopsies optiques à grand champ. Cette application est considérée comme un système qui prendrait en entrée des données brutes et délivrerait en sortie des mosaïques d’images à grand champ. Nous détaillons les éléments critiques du système avant d’en présenter la structure complete. Les données brutes sont difficiles à interpréter parce que modulées par la structure du réseau de fibres optiques et parce qu’entachées d’artefacts géométriques. Nous montrons qu’une reconstruction en temps réel permet d’obtenir des séquences vidéos directement interprétables. D’autre part, le mouvement relatif du tissu par rapport à la sonde optique implique qu’il est parfois difficile d’obtenir certaines mesures quantitatives. Nous avons donc attaqué le problème du recalage linéaire d’images. Nous montrons que des outils récents provenant du contrôle robotique par la vision peuvent surpasser les solutions standards utilisées en analyse d’images biomédicales. L’adéquation de ces outils nous a amenés à revisiter le problème du recalage non-linéaire. En interprétant le recalage non-linéaire comme un problème d’optimisation sur un groupe de Lie, nous développons un algorithme rapide de recalage difféomorphe. Finalement, nous proposons un algorithme robuste de création de mosaïques d’images. Cet algorithme a été incorporé dans un essai clinique.

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Informations

  • Détails : 1 vol. ( 172 p.)
  • Annexes : Bibliographie 160 réf.

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  • Cote : EMP 153.917 CCL. TH. 1217
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