Gestion des bases de données biologiques sur grilles de calcul

par Gaël Le Mahec

Thèse de doctorat en Informatique

Sous la direction de Frédéric Desprez.

Soutenue en 2008

à Clermont-Ferrand 2 .


  • Résumé

    L'utilisation de la grille pour la recherche en biologie et bioinformatique est un atout considérable, cependant de nouvelles problématiques apparaissent quant à la gestion des données ainsi que dans l'ordonnancement des tâches qui doit prendre en compte la taille et la disponibilité des données. Cette thèse aborde ces problématiques nouvelles en prenant en compte les spécificités des bases de données biologiques pour une utilisation efficace de la grille. Nous montrons l'intérêt des approches semi-statiques joignant réplications de données et ordonnancement des tâches. La mise en place d'une plateforme de soumission de requêtes BLAST a mené à la conception d'un nouveau gestionnaire de données pour l'intergiciel DIET : DAGDA. Au delà des applications de bioinformatique, ce gestionnaire de données peut répondre aux besoins de nombreuses applications portées sur les grilles de calcul

  • Titre traduit

    Liological databases management on computing grids


  • Pas de résumé disponible.

Consulter en bibliothèque

La version de soutenance existe sous forme papier

Informations

  • Détails : 1 vol. (171 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p.141-147

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Bibliothèque Clermont Université (Aubière). Section Sciences et Techniques.
  • Disponible pour le PEB
Voir dans le Sudoc, catalogue collectif des bibliothèques de l'enseignement supérieur et de la recherche.