Régulation de l'expression génique par formation de complexes boucle-boucles ARN : application de la technique de SELEX génomique aux interactions ARN/ ARN

par Marguerite Watrin

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et médicales. Biologie - Santé

Sous la direction de Jean-Jacques Toulmé.

Soutenue en 2008

à Bordeaux 2 .

  • Titre traduit

    Loop-loop complexes formation and regulation of gene expression : adaptation of the genomic SELEX technology to RNA/ RNA interactions


  • Pas de résumé disponible.


  • Résumé

    L'acide ribonucléique (ARN) ne joue pas seulement le rôle de transfert de l'information génétique, d'intermédiaire entre le gène et sa protéine. ARNt et ARNr participent à la synthèse des protéines au même titre que les ARNm, miARN, ARNqno et autres ARNmc sont impliqués dans la régulation de phénomènes biologiques tels que la réplication de plasmide, la transcription, la traduction, l'épissage. . . Les ARN ont notamment la possibilité de former des structures en tige-boucles, d'interagir via les boucles avec un acide nucléique partenaire, et de former des complexes boucle-boucles nommés kissing complexes. Chez E. Coli, la formation du kissing complexe RNAI-RNAII est à l'origine de la régulation de la réplication du plasmide ColE1. Un aptamère structuré en tige-boucle (R-06) a été sélectionné in vitro contre l'élément TAR situé dans la région 5' non codante de l'ARN du virus de l'immunodéficience humaine VIH-1. La formation du kissing complexe artificiel R-06/TAR est à l'origine de l'inhibition de la transactivation du génome viral. Nos travaux ont permis d'identifier dans le génome humain des ligands ARN structurés en tige-boucles et capables de former des kissing complexes naturels ou artificiels avec TAR ou bien avec une tige-boucle ARN cible contenant le motif RNGG, RYRY, ou YUNR. La formation de tels complexes pourrait traduire l'existence de régulations naturelles, ou bien permettre une régulation artificielle de gènes humains. Dans le cadre de cette thèse, la technique du SELEX génomique (Systematic Evolution of Ligands by Exponential enrichment) a pour la 1ère fois été adaptée aux interactions ARN/ARN et à la présence de banques d'ARN cibles.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (345 f.)
  • Annexes : Bibliogr. f. 319-345

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  • Bibliothèque : Université de Bordeaux. Direction de la Documentation. Bibliothèque des Sciences du Vivant et de la Santé.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : CMTB 2008-1548
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