Étude par imagerie cellulaire d'une nouvelle famille d'ARNs non-codants dont les gènes sont soumis à l'empreinte génomique parentale

par Hélène Royo

Thèse de doctorat en Biologie moléculaire et cellulaire

Sous la direction de Jérôme Cavaillé.

Soutenue en 2007

à Toulouse 3 .


  • Résumé

    Les loci Dlk1-Gtl2 et Snurf-Snrpn soumis à l'empreinte génomique parentale sont caractérisés par des unités de transcription complexes qui génèrent des ARNs noncodants mal caractérisés. Afin de mieux comprendre le devenir intracellulaire de ces ARNs, des hybridations in situ en fluorescence ont été réalisées sur le long gène noncodant Bsr au locus Dlk1-Gtl2 de rat. Dans des fibroblastes et des neurones embryonnaires, les transcrits Bsr épissés ne sont détectés que dans le noyau. Ils s'accumulent sous forme de " track " au site de transcription et forment de nombreux foci nucléoplasmiques stables qui ne colocalisent avec aucun compartiment nucléaire connu. Un profil similaire est trouvé pour des transcrits épissés non-codants du locus Snurf-Snrpn. Sous l'effet de drogues, des ARNs Bsr sont détectés dans le cytoplasme associés aux granules de stress. Les transcrits épissés des domaines Dlk1-Gtl2 et Snurf-Snrpn pourraient représenter une nouvelle famille d'ARNs retenus dans le noyau.

  • Titre traduit

    Characterization of a new family of imprinted non-coding RNAs by cell imaging


  • Résumé

    The Dlk1-Gtl2 and Snurf-Snrpn imprinted loci arbor complex transcription units and generate non-coding RNAs that are badly characterized. In order to gain insight into the intracellular fate of these non-coding RNAs, we have carried out fluorescence in situ hybridizations on the long, non-coding Bsr gene at the rat Dlk1-Gtl2 domain. In embryonic fibroblasts and neurons, spliced Bsr RNAs are only detected in the nucleus. They accumulate as a track at the transcription site and form numerous discrete, stable, nucleoplasmic dots that do not colocalise with any known sub-nuclear compartment. A similar accumulation profile is found for spliced non-coding RNAs at the Snurf-Snrpn locus. Under certain drug treatments, spliced Bsr transcripts are detected in the cytoplasm associated with stress granules. Spliced RNAs at the Dlk1-Gtl2 and Snurf- Snrpn domains could represent a novel family of nuclear-retained RNAs.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (154 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. 138-153

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  • Bibliothèque : Université Paul Sabatier. Bibliothèque universitaire de sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 2007 TOU3 0324
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