Composition des communautés bactériennes dénitrifiantes au sein d'un aquifère alluvial et facteurs contrôlant leur structuration : relation entre structure des communautés et dénitrification

par Amaia Iribar

Thèse de doctorat en Écologie microbienne

Soutenue en 2007

à Toulouse 3 .

  • Titre traduit

    Denitrifier community composition in an alluvial aquifer and the controlling factors of their structuration : relationship between community structure and denitrification


  • Pas de résumé disponible.


  • Résumé

    Ce travail a eu comme objectif d'étudier corrélativement la répartition temporelle et spatiale de la dénitrification dans un aquifère alluvial, la composition des communautés bactériennes dénitrifiantes au sein des biofilms hétérotrophes de cet aquifère et les facteurs qui contrôlent leur structuration. Des descripteurs structuraux (PCR-DGGE, PCR-en temps 16S ARNr, nirS, nirK, nosZ ; Biolog-ECO) et des descripteurs fonctionnels (dénitrification in situ et dénitrification potentielle) ont été utilisés. Il a été démontré que la dénitrification assurée par les communautés bactériennes dépend de leur habitat qui conditionne leur structure et leur capacité à dénitrifier : les communautés bactériennes dénitrifiantes des biofilms hétérotrophes colonisant les particules de sédiment sont les responsables principales de la dénitrification et ont une composition differente de la celle des communautés libres dans les eaux souterraines. La structuration des communautés dénitrifiantes et la diversité métabolique de ces biofilms dépendent des flux de carbone et la concentration d'oxygène, variables aux niveaux spatial et temporel en fonction de la connectivité de la zone avec la rivière. En établissant des corrélations entre composition des communautés bactériennes dénitrifiantes et dénitrification au sein d'assemblages bactériens naturels, ce travail constitue une première étape vers la compréhension des relations structure/fonction susceptibles de régir la dénitrification à l'échelle de l'écosystème.

Consulter en bibliothèque

La version de soutenance existe sous forme papier

Informations

  • Détails : 1 vol. (255 f.)
  • Annexes : Bibliogr. f. 237-255

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université Paul Sabatier. Bibliothèque universitaire de sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 2007TOU30175
Voir dans le Sudoc, catalogue collectif des bibliothèques de l'enseignement supérieur et de la recherche.