Analysis of the function of human TAF15 in the regulation of gene expression

par Laure Jobert

Thèse de doctorat en Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie

Sous la direction de Laszlo Tora.

Soutenue en 2007

à l'Université Louis Pasteur (Strasbourg) .

  • Titre traduit

    Etude de la fonction de la protéine humaine TAF15 dans la régulation de l'expression génique


  • Résumé

    TAF15 (TBP-associated factor 15) constitue avec EWS (Ewing sarcoma) et TLS (translocated in liposarcoma) la famille des protéines TET, dont les gènes correspondants sont fréquemment transloqués dans les sarcomes humains. TAF15 fait partie d’une sous-population du facteur général de transcription TFIID et de l’ARN polymérase II. Une analyse sur puce à ADN a révélé que 7. 5% des gènes présents sur la puce sont dérégulés en absence de TAF15. Une analyse plus détaillée de certains gènes régulés par TAF15 a montré que TAF15 agit au niveau transcriptionnel et est recruté sur les transcrits de ses gènes cibles. En outre, TAF15 forme un nouveau complexe avec le petit ARN nucléaire U1 (U1 snRNA), qui est distinct de la particule ribonucléoprotéique U1 bien caractérisée dans l’épissage. Puisque TAF15 lie à la fois l’ARN U1 et ses transcrits cibles et contrôle aussi la transcription d’un groupe de gènes, TAF15 peut participer au couplage de la transcription et de l’épissage de certains gènes.


  • Résumé

    TAF15 (TBP-associated factor 15) forms with EWS (Ewing sarcoma) and TLS (translocated in liposarcoma) the TET protein family, whose genes are frequently translocated in human sarcomas. TAF15 has been identified on the basis of its association with a subpopulation of the general transcription factor TFIID and RNA polymerase II. We found by gene expression profiling that about 7. 5% of the genes were misregulated upon TAF15 knockdown. A detailed analysis of certain TAF15-regulated genes showed that TAF15 acts at the transcriptional level and is recruited on the transcripts of its target genes. Most importantly, TAF15 can form a novel complex with the spliceosomal small nuclear U1 RNA (U1 snRNA) that is distinct from the well-characterized small nuclear ribonucleoprotein U1 particle. Since TAF15 binds both the U1 snRNA and its target transcripts and also controls transcription of a specific set of genes, TAF15 may participate in the coupling of transcription and splicing on certain genes.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (225 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. p. 193-225

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  • Bibliothèque : Université de Strasbourg. Service commun de la documentation. Bibliothèque Blaise Pascal.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : Th.Strbg.Sc.2007;5554
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