Induction, suppression, amplification of RNA silencing during viral infection

par Guillaume Moissiard

Thèse de doctorat en Biologie moléculaire

Sous la direction de Mario Keller.

Soutenue en 2007

à l'Université Louis Pasteur (Strasbourg) .

  • Titre traduit

    Etude de l'induction, de la suppression et de l'amplification du RNA silencing en contexte phytoviral


  • Résumé

    L’ARN silencing est un mécanisme de régulation négative de l’expression des gènes par des interactions entre molécules d’ARN. Un ARN double-brin est découpé par Dicer en “short-interfering (si)RNA” de 21 à 24-nt incorporant un “RNA-Induced Silencing Complex”, pour guider le clivage d’ARNm cible de manière séquence spécifique. Le silencing joue un rôle important dans la lutte antivirale chez les plantes. De plus, la plupart des phytovirus produisent des protéines suppresseurs de silencing. Le silencing peut être amplifié par l’activité d’ARN-dépendante ARN polymérases (RDR) cellulaires. Nous avons étudié l’ARN silencing au cours de l’infection par le Cauliflower mosaic virus (CaMV) et montré que les quatre protéines Dicer-like (DCLs) d’Arabidopsis étaient impliquées dans ce mécanisme. Nous avons analysé les interactions entre cinq suppresseurs et l’activité de RDR6 et identifié les DCLs associés à RDR6. Nous avons découvert que dans certains cas, RDR6 utilise le siRNA comme une amorce.


  • Résumé

    RNA silencing is a mechanism involved in the suppression of gene expression through nucleotide sequence-specific interactions mediated by RNA. A double-stranded RNA is processed by Dicer into 21- to 24-nt RNAs, called short-interfering (si)RNA that incorporate into a RNA-Induced Silencing Complex, to guide cleavage target mRNA in a sequence-specific manner. RNA silencing plays important antiviral role in plants. In parallel, most of phytoviruses produce suppressor proteins to counteract RNA silencing. RNA silencing can be amplified through the activity of the cellular RNA-dependent RNA polymerase (RDR). We studied RNA silencing during Cauliflower mosaic virus (CaMV) infection. We found that the four Arabidopsis Dicer-like (DCLs) proteins are involved to produce two classes of viral siRNAs. Then, we analysed the interactions between five silencing suppressors and RDR6 and identified the DCLs associated to RDR6. We also showed that, at least in some cases, RDR6 uses small RNAs as primers.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (Pagination multiple)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. f. 113-126

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  • Bibliothèque : Université de Strasbourg. Service commun de la documentation. Bibliothèque Blaise Pascal.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : Th.Strbg.Sc.2007;5356
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