L'influence des circulations hydrologiques sur la structure des communautés bactériennes à l’interface sol-nappe

par Nolwenn Bougon

Thèse de doctorat en Sciences de la Terre

Sous la direction de Luc Aquilina et de Philippe Vandenkoornhuyse.

Soutenue en 2007

à Rennes 1 .


  • Résumé

    Les relations entre les flux hydrologiques et le fonctionnement de l’écosystème sont abordées par 3 axes: l’influence des flux verticaux sur l’activité et la structure des communautés bactériennes réduisant les nitrates (gène narG) ; des flux verticaux sur la structure des communautés bactériennes taxonomiques (gène de l’ARNr 16S) et fonctionnelles (gène narG) ; et des modifications des paramètres de forçage sur l’expression protéique par une approche Métaprotéomique. Les analyses de diversités ont été réalisées par une approche de T-RFLP, complétées par une approche phylogénétique sur le gène de l’ARNr 16S. L’importance des circulations hydrologiques sur les communautés bactériennes a été confirmée en agissant directement sur la structure des communautés ou indirectement par la distribution de ressources. Le protéome des cellules exposées à deux sources de carbones ont été montré comme significativement différents, suggérant une réponse différentielle suivant la nature de la pollution induite. De plus la nature du carbone est un facteur primordial pour réduire efficacement les nitrates.

  • Titre traduit

    Hydrological fluxes influence on microbial community structure at the interface soil-watertable


  • Résumé

    The relationships between water-fluxes and ecosystem functioning were addressed by three axes: (1) influence of horizontal fluxes on the structure of nitrates’ reducers community (narG gene); (2) influence of vertical fluxes on the structure of taxonomic (16S rRNA gene) microbial community and nitrates’ reducers (narG gene) more specifically; and (3) influence of the modifications of ‘forcing’ parameters on proteins expressions. Diversity analyses were performed by a T-RFLP approach, and completed by phylogeny on the 16S rRNA gene. The importance of hydrological fluxes on microbial communities was confirmed by acting directly on the community structure or indirectly by resource distribution. The proteome of exposed bacterial cells to two carbons sources were shown as significantly different, suggesting a differential response face to the nature of pollution. Moreover, the carbon nature is a fundamental parameter to an efficiency nitrate removal.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (323 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. p. 276-302

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  • Bibliothèque : Université de Rennes I. Service commun de la documentation. Section sciences et philosophie.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TA RENNES 2007/145
  • Bibliothèque : Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes. Bibliothèque.
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : B17036
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