Annotation fonctionnelle de groupes de gènes issus de l'analyse transcriptomique

par Marc Aubry

Thèse de doctorat en Médecine. Biologie et sciences de la santé

Sous la direction de Jean Mosser.

Soutenue en 2007

à Rennes 1 .


  • Résumé

    Nous présentons ici une méthode d'annotation fonctionnelle basée sur le niveau de preuve (GOA) et sur l'exploitation des données issues de la littérature (Pubgene). Nous comparons et discutons ces deux aspects de notre méthodologie. En particulier, nous expliquons en quoi cette méthode hybride permet d'élaborer un meilleur profil fonctionnel pour un groupe de (produits de ) gènes. Nous évaluons également notre méthode à l'aune d'un outil académique disponible sur Internet (GO Tre Machine). Enfin, nous considérons les apports et les limites des relations d'association entre les terme des ontologies de GO dans la perspective d'enrichir le profil fonctionnel d'un groupe de (produits de ) gènes.

  • Titre traduit

    Functional annotation of genes in transcriptomic studies


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Informations

  • Détails : 1 vol. (238 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p 227-238

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université de Rennes I. Service commun de la documentation. Section santé.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 370050/2007/103/D
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