Diversité génétique du virus de l'hépatite delta (HDV) en Europe et en Afrique : caractérisation et implications en virologie médicale

par Frédéric Le Gal

Thèse de doctorat en Biologie. Virologie

Sous la direction de Paul Deny.

Soutenue en 2007

à Paris 13 .


  • Résumé

    Le virus de l’hépatite delta (HDV), est satellite du virus de l’hépatite B. La variabilité génétique de HDV a conduit à la définition de génotypes viraux, présentant une répartition géographique spécifique. Les travaux antérieurs du laboratoire ont permis l’identification de 7 génotypes distincts. L’activité « Centre National de Référence du Virus de l’Hépatite Delta » de notre laboratoire nous a permis de caractériser 606 isolats provenant de patients suivis en France et d’identifier un 8ème génotype (HDV-8). Environ 78% des patients présentaient le génotype majoritaire et ubiquitaire HDV-1, 0. 1% HDV-2, 16. 3% HDV-5, 1. 2% HDV-6, 3. 6% HDV-7 et 0. 9% à HDV-8. La totalité des patients infectés par les virus de types -5, -6, -7 et -8 était d’origine africaine. Une grande diversité génétique a de plus été mise en évidence au sein du génotype HDV-1, conduisant à l’individualisation de 3 sous-types : HDV-1AB (isolats originaires d’Europe/Asie), HDV-1C1 et 1C2 (Afrique). Une étude menée en collaboration avec l’Université d’Istanbul nous a permis de retrouver cette diversité des virus HDV-1 au sein des souches circulant en Turquie. L’ensemble de nos résultats nous a conduit à émettre l’hypothèse que HDV aurait pour origine l’Afrique d’où il aurait suivi le cours des migrations humaines via le Moyen-Orient. Nous avons de plus mis au point un test permettant la quantification plasmatique de l’ARN HDV quel que soit le génotype. Ce test, utilisé en routine au laboratoire, a été utilisé dans 2 études pilotes dans le cadre de collaborations avec d’une part l’hôpital Beaujon (France) et d’autre part l’hôpital Hippokration (Athènes, Grèce). Nos travaux ont permis de montrer la variabilité génétique de HDV. Celle-ci doit être prise en compte dans l’élaboration des tests diagnostics. Des études multicentriques prospectives permettront d’apprécier son retentissement sur le pouvoir pathogène du virus et la prise en charge thérapeutique.

  • Titre traduit

    Genetic diversity of hepatitis delta virus (HDV) in Europe and Africa : characterization and implications in medical virology


  • Résumé

    Hepatitis Delta Virus (HDV) is satellite of hepatitis B virus. The genetic variability of HDV has led to the definition of viral genotypes, presenting specific geographic distribution. Previous studies in our laboratory have allowed to identify 7 distinct genotypes. Our laboratory is a national reference centre for HDV. This has allowed us to characterize 606 isolates from patients followed in France, and to identify an 8th genotype (HDV-8). Approximately 78% patients were infected by HDV-1, which is the most common genotype. 0. 1% were infected by HDV-2, 16. 3% by HDV-5, 1. 2% by HDV-6, 3. 6% by HDV-7 and 0. 9% by HDV-8. All patients infected by viruses HDV-5, -6, -7 and -8 were of African origin. An important genetic diversity was evidenced among HDV-1 viruses, leading to the individualisation of 3 subtypes : HDV-1AB (isolates from Europe/Asia), HDV-1C1 and 1C2 (Africa). A collaborative study with the University of Istanbul allowed us to confirm this diversity of HDV-1 viruses among isolates circulating in Turkey. Taken together, our results tend to indicate that HDV might have originated from Africa and have followed the course of human migrations via Middle-East. We have developed a test to quantify HDV RNA in plasma whatever the viral genotype. This test, employed for routine diagnosis in our laboratory, was used in 2 pilot studies within the context of collaborations with Beaujon Hospital (France) and Hippokration Hospital (Athens, Greece). We have evidenced and characterized the genetic variability of HDV. This variability should be taken into account for the elaboration of diagnostic tests. Further multicenter prospective studies should allow to estimate the impact of the genetic variability on the course of the disease and on the treatment.

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Informations

  • Détails : 1 vol. ( 165 f.)
  • Annexes : Bibliogr. f.146-165

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  • Bibliothèque : Université Paris 13 (Villetaneuse, Seine-Saint-Denis). Bibliothèque universitaire. Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TH 2007 023
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