Implications fonctionnelles de l’organisation de la chromatine : Rôles du pore nucléaire chez saccharomyces cerevisiae

par Ghislain Cabal

Thèse de doctorat en Sciences biologiques. Biologie cellulaire

Sous la direction de Ulf Nehrbass.

Soutenue en 2007

à Paris 11 , en partenariat avec Université de Paris-Sud. Faculté des Sciences d'Orsay (Essonne) (autre partenaire) .


  • Résumé

    Dans le noyau des cellules eucaryotes, la chromatine ainsi que les processus métaboliques qui l’accompagnent ne sont pas distribués de manière aléatoire. Au cours de ma thèse, je me suis intéressé au rôle que pouvait jouer cette organisation dans la régulation de la réparation de l’ADN et de la transcription. J’ai participé à la mise au point de méthodes permettant de localiser in vivo un locus chromosomique unique et de le suivre au court du temps chez la levure Saccharomyces cerevisiae. J’ai ainsi pu montrer que les gènes GAL sont confinés dans des territoires bien définis et que leur mobilité est très contrainte. Par ailleurs, lorsqu’ils sont transcrits, les mouvements de ces gènes sont confinés le long de l’enveloppe nucléaire. Mes travaux ont également montré que le complexe d’initiation de la transcription SAGA interagissant avec le promoteur et les pores nucléaires (NPC) via la machinerie d’export des ARNm, était responsable de l’ancrage des gènes GAL à l’enveloppe nucléaire. Ces résultats constituent la première description du mécanisme de "gene gating". L’utilisation des techniques d’imagerie cellulaire, nous a aussi permis de montrer que la réparation des cassures de l’ADN dans les régions subtélomériques dépendait de leur ancrage aux NPC. Enfin, l’implication des pores dans le contrôle de la réparation de l’ADN a été confortée par l’identification d’interactions fonctionnelles entre certaines nucléoporines, et des protéines impliquées dans la réparation de l’ADN. Ensembles mes travaux démontrent l’importance des NPC dans l’organisation fonctionnelle de la chromatine chez S. Cerevisiae.

  • Titre traduit

    Role of nuclear pore and functional implication of chromatin organization in the yeast saccharomyces cerevisiae


  • Résumé

    In the nucleus of eukaryotic cells, chromatin and nuclear processes are not randomly distributed. During my PhD thesis, I have focused on the role of nuclear organization may play in regulating transcriptional regulation and DNA metabolism. To investigate this assumption, I developed an experimental system able to monitor the movement and sub-nuclear position of a single tagged genetic locus in the yeast Saccharomyces cerevisiae. When tracked in the nuclear volume over time, I found chromatin to undergo very constrained movement. Interestingly, I show that transcriptional activation of the GAL genes leads to the confinement of their motility towards the nuclear periphery. I further demonstrate that members of the SAGA transcription initiation complex and mRNA export factors mediate this recruitment by physically linking the activated GAL genes to nuclear pore complexes (NPC). These results prove for the first time that the ‘gene gating’ mechanism occurs in living cells. Additionally, I participated in a study showing that binding of chromosome ends to the NPC is essential for efficient DNA double strand break repair in subtelomeric region. I also performed a genetic screen revealing an exciting genetic interaction network of nucleoporins with the DNA repair machinery and chromatin remodeling complexes. Altogether the studies I carried out during my PhD uncover the role of the NPC in chromatin organization and consequently in regulating nuclear processes.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (188 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. 165-188

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université Paris-Sud (Orsay, Essonne). Service Commun de la Documentation. Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 0g ORSAY(2007)172
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