Agrégation de peptides amyloïdes par des simulations numériques

par Adrien Melquiond

Thèse de doctorat en Analyse du génome et modélisation moléculaire

Sous la direction de Philippe Derreumaux.

Soutenue en 2007

à Paris 7 .

  • Titre traduit

    Aggregation of amyloid peptides by computer simulations


  • Pas de résumé disponible.


  • Résumé

    Chez l'homme, plus de vingt maladies (telles que la maladie d'Alzheimer ou le diabète de type II) sont associées à l'auto-assemblage pathologique de protéines solubles dans des oligomères cytotoxiques et des fibres amyloïdes. Ce processus est complexe, ce qui rend difficile la caractérisation structurale de ces intermédiaires et la détermination des chemins d'agrégation. Dans ce travail, nous examinons dans un premier temps la surface d'énergie libre et la dynamique d'assemblage pour des petits peptides amyloïdes (KFFE et le fragment 22-27 de l'amyline) en utilisant le champ de force gros-grains OPEP (Optimized Potential for Efficient peptide-structure Prédiction) associé à la technique d'activation-relaxation (ART) et à la dynamique moléculaire (MD). Ensuite, nous présentons des simulations de dynamique moléculaire d'échange (REMD) sur les dimères des peptides d'Alzheimer Abeta (1-40) et Abeta (1-42) et nous discutons le rôle de la région 23-28 dans la formation de la fibre. Enfin, nous suivons les premières étapes de la dissociation d'un oligomère Abeta (16-22) en présence d'inhibiteurs N-méthylés par des simulations de MD-OPEP.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (130 f.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : 251 réf.

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université Paris Diderot - Paris 7. Service commun de la documentation. Bibliothèque Universitaire des Grands Moulins.
  • PEB soumis à condition
  • Cote : TS (2007) 053
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