Etude de la résistance du colza (Brassica napus) au Phoma (Leptosphaeria maculans) : étude des populations du pathogène et cartographie génétique des QTL impliqués dans la résistance

par Jean-Patrick Didier

Thèse de doctorat en Biologie végétale

Sous la direction de Martine Boccara.

Soutenue en 2007

à Paris 6 .

mots clés

• Colza
• Nécrose du collet
• Leptosphaeria maculans
• Phoma
• Qtl
• Cartographie génétique
• Résistance

Résumé

Leptosphaeria maculans est l’agent responsable de la Nécrose du collet du colza. Il est l’agent de la maladie la plus grave des Brassica spp. . L’utitlisation de gènes majeurs de resistance a permis de contrôler cette maladie, mais cet Ascomycète s’adapte très rapidement. Une collection de souches a été analysées pour connaitre la structure des races présentes au Canada. Durant mes travaux de recherche, j’ai construis une carte genetique du colza avec un taux de saturation de 50%. Les evaluations phénotypiques ont été faite en conditions contrôlées et au champ au Canada et Australia. L’analyse QTLs a été faite par deux méthodes à l’aide MapQTL. Le gène majeur de resistance a été identifiée avec un R2 variant entre 30 et 50%. De nombreux QTLs ont été observees pour la resistance commune entre le champ et le laboratoire et d’autres specifiques du champs. C’est la premiere fois que de la cartographie de la resistance pour L. Maculans a été faite entre le Canada et l’Australie et entre le resistance au champ et au laboratoire. Les futures travaux sont orientes l’extension de la carte genetique. Une cartographie de la resistance à Sclerotinia sclerotiorum a aussi été realisées.

Titre traduit

Mapping of resistance gene and QTLs in Brassica napus to Leptosphaeria maculans

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