Construire une ontologie de la pneumologie : aspects théoriques, modèles et expérimentations

par Audrey Baneyx

Thèse de doctorat en Information médicale

Sous la direction de Jean Charlet.

Soutenue en 2007

à Paris 6 .


  • Résumé

    Depuis une vingtaine d’années, l’accès aux connaissances médicales est un enjeu majeur pour lesprofessions de santé comme pour le grand public. Les limites actuelles des outils de traitementde l’information ne proviennent pas de leurs performances pour stocker et traiter rapidement desgros volumes, mais de leur incapacité à prendre en compte les spécificités des vocabulaires métierdes utilisateurs. Le développement de ressources terminologiques et ontologiques pour faciliterl’usage des terminologies nationales et internationales, disponibles notamment dans le domainede la médecine, revêt par conséquent une importance particulière. Il faut également souligner lapertinence de telles recherches dans la mouvance des Sciences et Technologies de l’Informationet de la Communication, dans le cadre de la société de l’information et dans le contexte du Websémantique. Dans ce contexte, notre réflexion a porté sur la collecte, l’organisation, la représentation et laformalisation des connaissances en médecine, tout particulièrement, dans le domaine de la pneumologie. Nous avons été amenés à considérer le problème dans son ensemble, afin de comprendrees mécanismes qui sous-tendent la constitution de ressources terminologiques et ontologiques à partir de textes. Nous avons également considéré chaque tâche séparément, afin de proposer,pour chaque étape, si ce n’est une solution, au moins un savoir-faire personnel susceptible d’apporterdes éléments de réponse. L’objectif principal de cette thèse consiste à mettre au pointune ontologie dans le domaine de la pneumologie pour faciliter, d’une part, l’aide au codagemédico-économique des pathologies et, d’autre part, la représentation des connaissances pertinentesrelatives au patient, dans ce domaine de spécialité. Nos recherches couvrent l’ensembledu cycle de vie d’une ontologie, de la mise au point d’une méthodologie de construction à partirde textes à son utilisation dans un système opérationnel. Nous contribuons aux recherches dansles domaines de l’Ingénierie des connaissances et de l’Informatique médicale. La méthode de travail adoptée est une démarche expérimentale ascendante qui consiste àpartir des problématiques concrètes rencontrées pour aller vers la résolution des questions scientifiquessous-jacentes. Selon cette démarche, nous avons tout d’abord cerné les besoins des pneumologuesen termes de représentation des connaissances. Ensuite, nous avons mis au point uneméthodologie, destinée à l’ingénieur des connaissances, fondée sur la méthode ARCHONTE définiepar B. Bachimont. L’enchaînement des processus d’extraction, de sélection et de choix descandidates termes du domaine ainsi que l’aide fournie par les patrons lexico-syntaxiques pour renseigner les principes différentiels la rende relativement facile d’emploi (ou moins difficilequ’une autre) pour un ingénieur des connaissances. L’ontologie construite compte à ce jour 2 260concepts primitifs. Enfin, nous avons développé un outil de codage semi-automatique proposantdeux types de codages : (1) un codage médical qui représente graphiquement les informations pertinentes relatives aux pathologies du patient et qui, à terme, servira de descripteur pour indexer intelligemment les comptes rendus d’hospitalisation ; (2) un codage médico-économiquepour lequel nous obtenons un rappel de 80% et une précision de 87%. Nos résultats concernant l’ontologie et l’outil nous encouragent à poursuivre nos recherches et à améliorer les solutions proposées.

  • Titre traduit

    Building an ontology of pneumology : theoretical aspects, models and experiments


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Informations

  • Détails : 1 vol. ([XX]-207p.)
  • Annexes : Bibliogr.p.165-178. 191 réf. bibliogr. Index

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  • Bibliothèque : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie . Section Mathématiques-Informatique Recherche.
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  • Cote : T Paris 6 2007 7
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