Adaptation aux variations d'environnement des souches commensales d'escherichia coli

par David Skurnik

Thèse de doctorat en Sciences de la vie et de la matière. Microbiologie

Sous la direction de Antoine Andremont et de Erick Denamur.


  • Résumé

    E. Coli est l'entérobactérie principale de la flore commensale intestinale. Elle est également une des principales causes d'inffection bactérienne chez l'homme. Au cours de notre travail de thèse nous avons étudié l'adaptation de cette espèce à la pression de sélection antibiotique, vers la résistance, actuellement un problème majeur de santé publique. Pour cela, nous avons analysé les variations de diverses caractéristiques (phénotype de résistance aux antibiotiques et au meercure, intégrons, diversité, répartition phylogénétiques, association à la virulence) liées à la résistance chez des échantillons de souches intestinales humaines et animales, recueillies dans des environnements spécifiques et contrastés.

  • Titre traduit

    Adaptation of commensal strains of Escherichia coli to environmental variations


  • Résumé

    We studied variations of characteristics of human and animal commensal E. Coli to variations of their hosts environment. Prevalence of antibiotic resisance, of integron, of mercury resistance, phylogenetic repartition and intra-host diversity were selected; More animals were ling near humans, more their commensal E. Coli were resistant and more the prevalence of integron was high, while the intra-host diversity decreased. In human commensal E. Coli, characteristics of isolates from expatriates living in French Guyana, were found intermediate between those found in isolates from residents in metropolitan france and those found in natives living permanently in french guyana, probably the result from their living in an environment close to that of the native Guyaneses but with a way of life close to that of residents living in metropolitan france. In conclusion our results suggest that the environment strongly influence the composition of the commensal intestinal flora of humans and animals.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (127 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliographie

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  • Cote : D 2007/24
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  • Cote : MFTH 7434
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