Conception de ligands protéiques par bioinformatique et modélisation moléculaire

par Cédrik Magis

Thèse de doctorat en Biochimie. Bioinformatique. Intéractions toxiques

Sous la direction de André Ménez.

Le président du jury était Max Goyffon.

Le jury était composé de Philippe Cuniasse, Thomas Haertlé.

Les rapporteurs étaient Solange Lavielle, Hugues Bédouelle.


  • Résumé

    L’accroissement des connaissances, structurales et fonctionnelles, des protéines nous donne désormais une vision plus précise des phénomènes d’interaction. Ce travail présente le développement d’une nouvelle méthode de conception de ligands protéiques, laquelle repose sur le transfert d’un groupe de résidus, appartenant à un ligand connu et contribuant de façon importante à la liaison avec une cible d’intérêt, sur une protéine hôte, de moins de 100 résidus (mini-protéines). Ces protéines hôtes sont identifiées de manière systématique dans la « Protein Data Bank ». L’approche a été appliquée pour le développement de ligands du canal Kv1. 2. Trois ligands, possédant des constantes d’inhibition micromolaires, ont été ainsi conçus.

  • Titre traduit

    Design of protein ligands by bioinformatic and molecular modeling


  • Résumé

    The increasing structural and functional knowledge of proteins gives us a clearer idea of how they interact. This work presents the development of a new method enabling the design of protein ligands based on the transfer of a set of aminoacids of a known ligand, contributing to the binding of a choosen target on an host protein, containing less than 100 residues (mini-proteins). These host proteins are identified from the “Protein Data Bank” in a systematic manner. This approach has been applied to the development of new ligands of the Kv1. 2 channel. Three ligands have been designed with inhibition constants in the micromolar range.

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Cette thèse a donné lieu à une publication en 2011 par [CCSD] [diffusion/distribution] à Villeurbanne

Conception de ligands protéiques par bioinformatique et modélisation moléculaire

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Informations

  • Détails : 1 vol. (290 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. 273-290

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  • Bibliothèque : Muséum national d'histoire naturelle. Bibliothèque centrale.
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : TH 2007 -- 04

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