Etude de complexes ribonucléoprotéiques impliqués dans la régulation de l'expression des protéines au cours de l'initiation de la traduction

par Marie Ménade

Thèse de doctorat en Biotechnologies, santé, management

Sous la direction de Emmanuel Drouet et de Pascal Chartrand.

Soutenue en 2007

à l'Université Joseph Fourier (Grenoble) .

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  • Résumé

    L'expression génique est régulée à de nombreuses étapes de la vie cellulaire. La synthèse des protéines ou traduction, étape ultime de cette expression, est finement régulée. Elle comporte trois phases: l'initiation, l'élongation et la terminaison. L'initiation commence par l'établissement de la sous-unité ribosomique 40S sur cet ARNm qu'elle balaye ensuite jusqu'au codon initiation. Pour cela, des facteurs canoniques sont impliqués. Parmi eux, le facteur elF3 interagit directement avec celle-ci. Au cours de mes travaux, j'ai étudié dans une première partie l'interaction putative entre le facteur elF3 et la petite sous-unité ribosomique 40S. Le ribosome est constitué par deux types d'entités: des protéines ribosomiques et l'ARNr. Lefacteur eIF3, contient au moins 13 sous-unités, dont deux possèdent un RRM, et sont potentiellement capables de lier cet ARNr via leur RRM: p44 et p116. ElF3p44 a montré auparavant qu'elle pouvait lier l'ARNr l8S. J'ai effectué un criblage d'une banque de ftagments de cet ARNr pour identifier un site de liaison de p44 sur la sous-unité 40S. Les ARNm néo-synthétisés sont transportés et localisés afin de permettre l'expression des protéines aumoment opportun et en un lieu précis de la cellule. Dans une deuxième partie, j'ai étudié des interactions impliquées dans le contrôle de l'initiation de la traduction d'un ARNm localisé chez la levure S. Cerevisiae pendant son transport: l'ARNm ASHI. Il est régulé par Khdlp, protéine à trois domaines KH, qui lie directement un de ses éléments de localisation. Cette interaction est abolie par la phosphorylation de Khd 1 P lorsque l'ARNm est correctement localisé.


  • Résumé

    Gene expression is ftequently regulated during cellular life. Protein synthesis, also called translation, is the last part ofthat expression and is wholly regulated. Translation is divided in three parts: initiation, elongation and termination. Initiation starts when the 40S ribosomal subunit binds the mRNA and scans it until it reaches the initiation codon. Many initiation factors are involved. Among them, elF3 directly binds that subunit. During my work, 1 studied in a first part the putative interaction between the factor eIF3 and the small ribosomal subunit 40S. The ribosome is constituted oftwo different entities: ribosomal proteins and rRNA. The factor elF3 contains at least 13 subunits. Two possess a RRM and are potentially able to bind that rRNA vif their RRM: p44 et p 116. ElF3p44 showed previously that it was able to bind l8S rRNA. 1 screened a library of 18S rRNA fragments with the aim of identifying a binding site ofp44 on the 40S subunit. The newly synthesized mRNAs are transported and localized into the cytoplasm to control spatiall~ and temporally protein expression. Ln a second part, 1 studied the interactions involved in translation initiation control of aS. Cerevisiae localized mRNA, ASH1, during its transport. Its regulation is mediated through its direct interaction with Khdlp, a three KH domain protein, on one ofits RNA localization elements. This interaction is abolished by Khdlp phosphorylation when ASHI mRNA is welliocalized.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (197 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. 262 réf.

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  • Bibliothèque : Service interétablissements de Documentation (Saint-Martin d'Hères, Isère). Bibliothèque universitaire de Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TS07/GRE1/0133/D
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