Approches multicritères de l'évolution de la variabilité génétique et de la taille efficace au sein des populations animales soumises à sélection

par Valérie Loywyck

Thèse de doctorat en Génétique animale

Sous la direction de Etienne Verrier.

Soutenue en 2007

à Paris, AgroParisTech .


  • Résumé

    L’objectif de cette thèse est double : examiner en détails d’une part, les liens entre les différents critères obtenus à partir de différents types d’information, tels que les marqueurs moléculaires, les pedigrees ou les phénotypes des caractères quantitatifs, et d’autre part, l’évolution conjointe de la variabilité neutre et de la variabilité sélectionnée. En fonction de la nature des informations, la variabilité génétique et son évolution sont décrites par différents paramètres qui s’appuient sur des modèles sous-jacents plus ou moins complexes et la représentation qu’on se fait de la diversité génétique sera donc plus ou moins réaliste. Ainsi, l’analyse du polymorphisme nous donne directement une image précise de la diversité au niveau du génome. Par exemple, les génotypes et les fréquences alléliques de gènes candidats, ou plus généralement de marqueurs moléculaires, nous donnent directement accès au polymorphisme spécifique à des gènes identifiés en des endroits précis du génome ; quant aux analyses basées sur les pedigrees, elles traduisent le polymorphisme en un locus neutre et anonyme, n’importe où dans le génome. Par contre, l’analyse des phénotypes nécessite des modèles de représentation plus complexes et nous une vue d’ensemble générale de la diversité génétique.

  • Titre traduit

    Analysis of the within-population genetic diversity and the effective size based on different kinds of information in selected animal populations


  • Résumé

    The scientific purpose of the thesis is twofold: to investigate in details the links between criteria originating from different kinds of information, such as molecular markers, pedigrees, or phenotypes for quantitative traits, to go further in the examination of the joint evolution of the neutral variability and the selected variability. According to the kind of information, genetic diversity and its evolution are described through various parameters dealing with more or less complex underlying model, thus, we will have more or less realistic representation of the genetic diversity. On one hand, analysis of polymorphism gives a direct overview of the diversity: genotypes and allele frequencies of candidate gene or molecular markers will give access to specific polymorphism of known areas in the genome, whereas pedigrees will give access to anonymous polymorphism of neutral unknown areas in the genome. On the other hand, analysis of phenotypes gives a general overview of genetic diversity, assuming the model of representation to be more complex.

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Informations

  • Détails : 1 vol. ( 138 p.)
  • Annexes : Bibliographie 179 réf.

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