Mise au point d'un indicateur microbiologique pour le suivi de la bioremédiation dans le sol : le quotient respiratoire

par Mira Taok

Thèse de doctorat en Biotechnologie

Sous la direction de Nelly Cochet-Giraud et de Schoefs, Olivier.

Soutenue en 2007

à Compiègne .


  • Résumé

    L'impact d'une contamination et de l'ajout de nutriment sur l'évolution dans le temps du quotient respiratoire (QR) du sol a été étudié en microcosmes. L'activité microbienne, mesurée par la production de CO2 et la concentration en ARN, et la croissance microbienne déterminée par culture sur boîte de Pétri et le contenu en ADN ont été suivies. La diversité génétique a été étudiée par construction de librairies de clones du gène 16S. Le QR a montré des variations dans le temps liées aux différentes phases de la réponse respiratoire et de la croissance microbienne. Après ajout du polluant, le QR a augmenté pour toutes les conditions testées. Les valeurs du QR ont diminué lorsqu'une forte activité de dégradation et une croissance microbienne ont eu lieu. Le QR a légèrement augmenté à la fin de l'incubation dans tous les microcosmes. Ces résultats montrent que le QR est un indicateur de l'état physiologique des microorganismes durant la biodégradation d'un polluant dans le sol.

  • Titre traduit

    Development of a microbial indicator to monitor soil bioremediation : the respiratory quotient


  • Résumé

    The effects of contamination and nutrient amendments on the variation in time of the respiratory quotient (RQ) were investigated in soil microcosms. Microbial activity measured by CO2 production and RNA content, biomass growth determined by plate counts technique and DNA content were monitored in order to check their relation to RQ fluctuations. PCR amplified 16S RNA genes were cloned and sequenced to analyze the diversity of bacterial communities. RQ values in all treatments displayed significant fluctuations over times which were closely related to the phases of the respiratory response as well as to microbial growth. After pollutant addition, an increase of RQ occurred in all microcosms. RQ values decreased when high degradation activity and microbial growth took place. RQ values slightly increased in all microcosms at the end of the incubation. These results show that the respiratory quotient is closely related to the physiological state of microorganisms.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (X-163 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. 195 réf.

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  • Bibliothèque : Université de Technologie de Compiègne. Service Commun de la Documentation.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 2007 TAO 1723
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