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Etude par dynamique moléculaire des protéines membranaires dans un milieu lipidique cohérent
| Auteur / Autrice : | Nada Taib-Maamar |
| Direction : | Michel Laguerre |
| Type : | Thèse de doctorat |
| Discipline(s) : | Sciences chimiques. Chimie - Physique |
| Date : | Soutenance en 2007 |
| Etablissement(s) : | Bordeaux 1 |
Mots clés
Résumé
La compréhension des processus biologiques dans les membranes protéolipidiques est un défi majeur car les protéines membranaires représentent 2/3 des cibles des drogues actuelles et elles sont essentielles au fonctions importantes de la cellule. L'étude structurale des protéines membranaires étant par essence difficile et la connaissance des événements à un niveau moléculaire est rare. Nous proposons donc une étude par dynamique moléculaire qui grâce à son approche atomique nous a permis de disséquer les caractéristiques structurales : hélicité, orientation, rayon de gyration. . . , la dynamique et le comportement des protéines appelées SNARE impliquées dans la fusion membranaire au niveau des neurones. Nous nous sommes intéressés à l'étude des domaines transmembranaires, juxtamembranaires et cytosoliques de ces protéines dans différents environnements : eau, octanol et bicouche lipidique de DMPC.