Influence du gène rpoS sur le protéome d’Escherichia Coli cultivées sous la forme de biofilm

par Anthony Collet

Thèse de doctorat en Biologie cellulaire

Sous la direction de Thierry Jouenne.

Soutenue en 2006

à Rouen .


  • Résumé

    Les bactéries vivant en biofilm sont différentes des bactéries vivant sous forme planctonique. Les biofilms posséderaient des traits caractéristiques de la phase stationnaire : croissance lente et activité métabolique adaptée. Le régulateur de la phase stationnaire chez Escherichia Coli est le facteur de transcription RpoS. Afin d’évaluer le rôle de RpoS chez E. Coli cultivée en biofilm, nous avons comparé les protéomes d’un mutant DrpoS avec le sauvage. Les travaux ont été réalisés sur des cellules planctoniques et sur des cellules adhérant (biofilm). Une analyse statistique en composante principale a été réalisée. Elle montre une faible influence de la mutation sur le protéome des bactéries en biofilm. Nous avons identifié des protéines dont l’expression est modifiée par la mutation et mis en évidence de nouvelles protéines sous contrôle RpoS. Certaines sont sous le contrôle de RpoS uniquement en biofilm, ce qui suggère l’existence de voies de régulation spécifique.


  • Résumé

    Bacteria present in biofilms behave quite differently from their planktonic counterparts. It has been suggested that mature biofilms cells have stationary growth phase traits as reduced growth and metabolic activity. The master regulator of stationary phase-specific gene expression in Escherichia Coli is RpoS. To investigate the role of RpoS in gene expression of E. Coli cells grown as biofilms, we compared proteomes of RpoS mutant with that of the wild strain. Experiments were performed on planktonic cells and on bacteria adhering on glass wool (biofilm). Principal component analysis was used to interpret the variations in protein spot densities. It demonstrated a low influence of RpoS deletion on sessile bacteria. We identified some new proteins of RpoS-dependent. Some of them are under control of RpoS only in biofilm. This suggest the existence of specific pathway of regulation.

Consulter en bibliothèque

La version de soutenance existe sous forme papier

Informations

  • Détails : 1 vol. (229 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr.413 réf. Contient des articles en anglais

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université de Rouen. Service commun de la documentation. Section sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 06/ROUE/S036
  • Bibliothèque : Université de Rouen. Service commun de la documentation. Section sciences site Madrillet.
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : 06/ROUE/S036
Voir dans le Sudoc, catalogue collectif des bibliothèques de l'enseignement supérieur et de la recherche.