Etude du protéome membranaire de souches d'Acinetobacter baumannii multirésistantes aux antibiotiques

par Axel Siroy

Thèse de doctorat en Chimie

Sous la direction de Thierry Jouenne.

Soutenue en 2006

à Rouen .

mots clés

• CarO
• Acinetobacter
• Résistance aux antibiotiques
• Électrophorèse bidimensionnelle
• Protéomique
• Membranes (biologie)
• Porines

Résumé

Le développement des épidémies d'infections à Acinetobacter baumannii en milieu hospitalier pose le problème de l'émergence des bactéries multirésistantes. Deux causes majeures peuvent expliquer cette résistance : l'existence d'enzymes de dégradation spécifiques ou la modification de la perméabilité membranaire. Nous avons analysé le protéome des membranes interne et externe de la souche type ATCC 19606 et identifié 135 protéines membranaires. La comparaison de ces protéomes entre celle-ci et une souche clinique résistante (CHU de Rouen) a permis de montrer chez cet isolat une modification structurale de CarO, des isoformes d'OmpW, la sous-expression de PonB et l'accumulation de protéines précurseurs des biofilms. L'analyse du sous-protéome membranaire d'une seconde souche résistante a montré la sous-expression des protéines CarO et montré sa capacité à former des canaux ioniques.

Titre traduit

Study of the membrane subproteomes of multidrug resistant Acinetobacter baumanii strains

Résumé

The recent increase of Acinetobacter baumannii outbreaks in hospital environment highlights problems to antibiotic multi-drug resistance. This feature can be explained by the production of antibiotic degrading enzymes or by alterations in the cell wall permeability. We investigated inner and outer membrane subproteomes of the ATCC 19606 type strain and identified 135 membrane proteins. By comparing the subproteomes of the reference strain with those obtained from a MDR isolate (Rouen Hospital), we showed that this isolate exhibits some structural modifications in CarO, different isoforms of OmpW, under-expresses PonB and accumulates proteins involved in the first steps of biofilm formation. The analysis of the outer membrane proteins profile of a second MDR strain highlighted the under-expression of CarO and an OprD-like proteins. We consequently investigated structural and functional properties of CarO and highlighted its ability to form ionic channels.