Etude par spectroscopie optique d'associations d'acides nucléiques en fonction de leur hydratation, de leurs contre-ions ou en interaction avec la protéine régulatrice Hfq

Study by optical spectroscopy of nucleic acid associations in relationship with their hydration, the counterions and in interaction with the regulatory protein Hfq

• Auteur / Autrice : Maria Eugenia Romero Guzman
• Direction : Jean Liquier
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Physique ; mention biophysique moléculaire
• Date : Soutenance en 2006
• Etablissement(s) : Paris 13

Mots clés

Mots clés contrôlés

Protéines

Hydratation

Fourier, Spectroscopie infrarouge à transformée de

Résumé

La première partie de cette thèse concerne l'hydratation de dAn•dTn et rAn•rUn, et des triple-hélices dTn*dAn•dTn, rUn*dAn•dTn, dTn*rAn•rUn et rUn*rAn•rUn. Leurs taux d'hydratation sont obtenus par des mesures gravimétriques. Les profils des courbes de desorption obtenus par pesées et FTIR sont corrélés avec des modifications conformationnelles induites par la déshydratation. La deuxième partie traite des télomères humains et d'Oxytricha nova pouvant former des quadruple-hélices. Une bande infrarouge, marqueur de l'orientation parallèle ou antiparallèle des quadruple-hélices, est proposée. L'effet de l'addition d'ions métalliques Na+, K+ ou Ca2+ sur les orientations relatives des brins est examiné. La troisième partie concerne la structure de Hfq de E. Coli et ses interactions avec des ARN (rU7, rA7 et rC7) en relation avec son rôle fonctionnel. Hfq seule forme une structure de feuillets bêtapolymérisés en fibre (empilement de 36 monomères agencés en hexamères d'homohéxamères).