Étude structurale du filament des recombinases par des approches de spectroscopie optique et de modélisation moléculaire

par Sébastien Conilleau

Thèse de doctorat en Biochimie

Sous la direction de Masayuki Takahashi.

Soutenue en 2006

à Nantes .


  • Résumé

    La recombinaison homologue est un processus universel d'échange d'un brin d'ADN entre deux molécules de séquences équivalentes. Elle est catalysée par des protéines conservées depuis les phages jusqu'aux hommes : les recombinases (RecA Eubactérienne, RadA Archae et Rad51 Eucaryote). Les recombinases sont actives sous la forme d'un filament formé sur l'ADN simple-brin en présence d'ATP. Elles hydrolysent l'ATP et il existe deux conformations du filament associées à l'état du co-facteur (ATP/ADP). Dans la première partie de ce travail nous avons mis en évidence les similitudes existantes entre les interfaces protéine-protéine des filaments de recombinases eucaryotes, inconnues jusqu'alors, et eubactériennes par une approche de spectroscopie optique. Dans un second temps nous avons mis en place une stratégie de modélisation moléculaire qui nous permet de proposer, pour la première fois, des modèles de chacune des conformations des filaments.


  • Résumé

    Homologous recombination is the universally conserved process of strand exchange between two DNA molecules of similar sequences. It is catalysed by a family of proteins found from phages to human : recombinases (Eubacterian RecA, Archaeal RadA and Eucaryotic Rad51). Recombinases are active as a filament formed on single-strand DNA in the presence of ATP. They hydrolyze ATP and two conformational states of the filament exist, each associated with one type of co-factor (ATP/ADP). In the first part of this work, using optical spectroscopy, we proved that the previously unknown protein-protein interface in the eucaryotic recombinase filament to have similarities to that of eubacterian recombinase. Secondly we computationaly modelled each of the filament conformation. This is the first time that such a model of the two states has been proposed at the molecular scale.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (202 f.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliographie p. 181-202

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  • Bibliothèque : Université de Nantes. Service commun de la documentation. Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 2006 NANT 2030
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