Développement d'outils biostatistiques pour l'analyse de biopuces en cancérologie

par Caroline Bascoul Mollevi

Thèse de doctorat en Biostatistique

Sous la direction de Andrew Kramar.


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  • Résumé

    Les biopuces représentent une des technologies émergeant en génomique depuis ces dix dernières années promettant de nouvelles avancées dans le diagnostic moléculaire et la recherche biomédicale en général. L'analyse de données issues des biopuces pose encore de nombreux problèmes et le développement de nouvelles méthodes statistiques robustes est nécessaire. L'orientation essentielle de cette thèse est de proposer une procédure d'analyse utilisant les méthodes liées à l'évaluation diagnostique pour déterminer les gènes impliqués dans les mécanismes à étudier. Des indices tels que l'aire totale ou partielle sous la courbe ROC permettront d'identifier des gènes capables soit de discriminer globalement les deux populations, soit de détecter plus spécifiquement l'une d'entre elles. Dans un premier temps, une étude précise des différents indices liés aux courbes ROC ainsi que des procédures d'estimation des variances a été réalisée. Ensuite, nous avons développé un nouvel estimateur de l'aire partielle basé sur la méthode non-paramétrique du noyau. Une étude de simulation a montré la supériorité de celui-ci sur l'estimateur empirique classique quand les distributions des résultats des tests sont issues de distributions mélangées. Enfin, l'application et l'utilisation de la méthodologie développée ont été mises en oeuvre sur les données du programme REG/P, dont l'objectif principal était d'identifier des gènes marqueurs ou effecteurs de la chimiorésistance dans les cancers colorectaux. Une signature prédictive de la réponse au schéma Folfiri a pu être déterminée et une étude de validation sur une cohorte de patients indépendants est actuellement initiée.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (154 f.)
  • Annexes : Bibliogr. f. 124-132

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  • Bibliothèque : Bibliothèque interuniversitaire. Section Médecine-Unité pédagogique médicale.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TU 2006.MON-13
  • Bibliothèque : Bibliothèque interuniversitaire. Section Médecine.
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  • Cote : TU 2006.MON-13
  • Bibliothèque : Bibliothèque interuniversitaire de santé (Paris). Pôle pharmacie, biologie et cosmétologie.
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : MFTH 6949
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