Oiseaux sauvages et virus West Nile : étude éco-épidémiologique en Camargue

par Elsa Jourdain

Thèse de doctorat en Méthodes de recherche sur l'environnement et la santé

Sous la direction de Philippe Sabatier et de Michel Gauthier-Clerc.

Soutenue en 2006

à l'Université Joseph Fourier (Grenoble) .


  • Résumé

    Le travail présenté ici s'intéresse au rôle des oiseaux sauvages dans l'épidémiologie du virus West Nile (WN) en Camargue. Des espèces d'oiseaux susceptibles d'intervenir dans les différentes phases de circulation du virus (introduction, amplification, dispersion, émergence) sont identifiées en s'appuyant sur les données bibliograpbiques relatives à la maladie et sur des critéres ornithologiques. Les investigations épidémiologiques effectuées pour quelques unes de ces espèces en 2004 (année épizootique) et en 2005 (année post-épizootique) montrent que le virus WN circule dans la population d'oiseaux de Camargue. Pour les oiseaux migrateurs arrivant d' Afrique au printemps, les dates et lieux de ces contacts restent inconnus. Concernant les oiseaux sédentaires, deux isolats d'une même souche virale ont été obtenus en 2004, réciproquement à partir du cerveau d'une Pie bavarde Pica pica et d'un Moineau domestique Passer domesticus, et totalement séquencés. L'étude phylogénétique de cette souche montre qu'elle appartient au même cluster que celles précédemment isolées en Europe méditerranéenne. Les résultats sérologiques et virologiques chez ces deux espèces d'oiseaux, souvent observées à proximité des écuries, en font des candidates à l'amplification et l'émergence du virus WN chez les chevaux de Camargue. La mise en évidence, en 2005, d'ARN viral dans les fientes d'une Pie bavarde conforte cette hypothèse. Les recherches doivent se poursuivre pour évaluer la part respective des différents oiseaux de Camargue dans la circulation du virus WN en utilisant d'autres approches, comme par exemple l'analyse des repas de sang des moustiques vecteurs, récemment identifiés.


  • Pas de résumé disponible.

  • Titre traduit

    Wild birds and west nile virus : eco-epidemiologic study ln the camargue


  • Résumé

    The work presented here deals with the role of wild birds in West Nile (WN) virus epidemiology in the Camargue. Bird species likely to be involved in the various steps ofWN virus circulation (introduction, amplification, spread, emergence) are identified using bibliograpbic data on WN disease and omithological criteria. Epidemiological investigations focused on sorne ofthese species during the years 2004 (epizootic year) and 2005 (postepizootic year) show that WN virus is circulating in the Camargue bird population. Dates and locations ofthese contacts are unknown for migrating birds arriving from Africa in spring. Conversely, in sedentary birds, two isolates of a single strain were obtained in 2004, fTom the brain of a Common magpie Pica pica and a House sparrow Passer domesticus, respectively. They were totally sequenced. Phylogenetic analysis oftbis strain shows that it belongs to the same cluster as the other strains previously isolated in Mediterranean Europe. Serological and virological results in these two bird species, wbich are often seen in close proximity with horse farms, suggest that they are good candidates for WN virus amplification and emergence in horses. This hypothesis is also supported by the fact that viral RNA was found in the feces of a Common magpie in 2005. Investigations have to be pursued to assess how the various Camargue bird species are involved, respectively, in WN virus circulation. Other approaches should be used, like blood meal analysis of mosquito vectors, wbich were recently identified.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (204 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. en fin de chapitres

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  • Bibliothèque : Service interétablissements de Documentation (Saint-Martin d'Hères, Isère). Bibliothèque universitaire de Sciences.
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : TS06/GRE1/0261
  • Bibliothèque : Service interétablissements de Documentation (Saint-Martin d'Hères, Isère). Bibliothèque universitaire de Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TS06/GRE1/0261/D
  • Bibliothèque : Muséum national d'histoire naturelle. Bibliothèque de zoologie-mammifères et oiseaux.
  • Disponible sous forme de reproduction pour le PEB
  • Cote : A 308-185
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