Etude d'un ligand de haute affinité pour l'intégrase du VIH-1 : structure et mécanisme d'inhibition in vitro et ex vivo de l'oligodeoxynucleotide 93del

par Aurélie Perraud

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et médicales. Biologie-Santé

Sous la direction de Marie-Line Andréola.

Soutenue en 2006

à Bordeaux 2 .


  • Résumé

    L'infection par le Virus de l'Immunodéficience Humaine de type 1 (VIH-1) reste un grave problème qui nécessite le développement de nouveaux antirétroviraux. L'intégrase (IN) est une cible thérapeutique potentielle. Sélectionné par une stratégie combinatoire, l'oligodeoxynucléotide (ODN) 93del inhibe spécifiquement les activités in vitro de l'IN catalysées par des formes oligomériques distinctes de l'enzyme. En solution, l'ODN 93del se structure en quartet de G dimérique. Selon un modèle de docking moléculaire, il peut se loger dans la cavité formée par un tétramère d'IN. Comme cet oligomère est impliqué dans l'intégration, le tétramère d'IN devrait constituer la forme ciblée par les inhibiteurs dans la cellule infectée. L'ODN 93 del inhibe aussi les étapes très précoces du cycle de réplication ex vivo. Il pourra donc servir de base pour l'obtention de futurs inhibiteurs.

  • Titre traduit

    Study of a high affinity ligand of HIV-1 Integrase : structure and mechanism of inhibition in vitro and ex vivo of oligodeoxynucleotide 93 del


  • Résumé

    Human Immunodeficiency Virus type 1 (HIV-1) infection still remains a serious problem. Finding new antiretroviral is needed. Integrase (IN) is a potential therapeutical target. Selected by a combinatory strategy, oligodeoxynucleotide (ODN) 93del inhibits specifically in vitro activities of IN catalysed by different enzyme oligomeric forms. In solution, ODN 93del is structured in a dimeric G quartet. In a molecular docking model, it is able to fit in a cavity formed by a tetramer of IN. As integration is catalysed by this oligomer, IN tetrameric would be the target of inhibitors in infected cell. Moreover, 93del inhibits early steps of viral cycle ex vivo. Consequently, ODN 93del might be used as a model to find new inhibitors.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (131 f.)
  • Notes : Thèse confidentielle jusqu'au 31/12/2009
  • Annexes : Bibliogr. réf. p. 121-131

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  • Cote : CMTB 2006-1377
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  • Cote : MFTH 9566

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  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : 2006BOR21377
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