Recherche de déterminants moléculaires impliqués dans la spécificité d'hôte de Xanthomonas axonopodis pv. Phaseoli et son variant fuscans

par Seyed Mehdi Alavi

Thèse de doctorat en Biologie cellulaire et moléculaire végétale

Sous la direction de Charles Manceau.

Soutenue en 2006

à Angers .


  • Résumé

    Xanthomonas axonopodis pv. Phaseoli (Xap) et son variant fuscans (Xapf) sont les agents pathogènes responsables de la graisse commune du haricot. Cette maladie provoque des pertes économiques assez importantes dans les zones de la production du haricot. Le principal objectif de cette étude est la recherche de déterminants moléculaires dans la spécificité d'hôte chez ces bactéries. Dans un premier temps, notre étude a consisté en la caractérisation d'une nouvelle séquence d'insertion (ISXax1) appartenant à la famille IS256. Cette IS présente un large polymorphisme d'insertion chez les souches de Xap et Xapt mais également chez les souches de X. A pv. Vesicatoria, agent de la gale bactérienne de la tomate et du poivron. L'étude de cette IS semble montrer qu'elle ne joue aucun rôle dans la spécificité d'hôte de ces bactéries. Dans un deuxième temps, quatre hybridations soustractives suppressives (SSHs) ont été réalisées à partir de souches représentatives des quatre lignées génétiques (1 lignée fuscans et 3 lignées non-fuscans) du pathovar phaseoli. Quarante séquences d'ADN uniques et spécifiques du pathovar phaseoli ont ainsi été identifiées. Parmi elles, seulement 9 séquences sont partagées par les 4 souches utilisées pour les SSHs, confirmant la très large hétérogénéité génétique du pathovar. Certaines des séquences soustraites, probablement acquises par transfert horizontal, sont des homologues de gènes codant potentiellement pour des protéines impliquées dans le pouvoir pathogène et/ou la spécificité d'hôte telles que : deux hémagglutinines, un récepteur Ton-B dépendant, des protéines impliquées dans les systèmes de sécrétion de type III et IV et deux effecteurs de type III. Une mutagénèse dirigée des homologues des gènes avrBsT, xopC et traF a été entreprise afin de vérifier leurs rôles chez Xanthomonas axonopodis pv. Phaseoli.

  • Titre traduit

    Research for host specific molecular determinants of Xanthomonas axonopodis pv. Phaseoli and its fuscans variant


  • Résumé

    Xanthomonas axonopodis pv. Phaseoli (Xap) and its variant fuscans (Xapf) are the pathogens responsible for common bean fat. This disease causes fairly significant economic losses in areas of bean production. The main objective of this study is the search for molecular determinants in host specificity in these bacteria. First, our study consisted of the characterization of a new insertion sequence (ISXax1) belonging to the IS256 family. This IS exhibits a large insertion polymorphism in the Xap and Xapt strains but also in the X. A pv strains. Vesicatoria, agent of bacterial mange of tomato and pepper. The study of this IS seems to show that it plays no role in the host specificity of these bacteria. In a second step, four subtractive suppressive hybridizations (SSHs) were carried out from representative strains of the four genetic lines (1 fuscans line and 3 non-fuscans lines) of pathovar phaseoli. Forty unique DNA sequences specific for pathovar phaseoli have been identified. Among them, only 9 sequences are shared by the 4 strains used for SSHs, confirming the very wide genetic heterogeneity of the pathovar. Some of the subtracted sequences, probably acquired by horizontal transfer, are homologs of potentially coding genes for proteins involved in pathogenicity and / or host specificity such as: two hemagglutinins, a dependent Ton-B receptor, proteins involved in type III and IV secretion systems and two type III effectors. Site-directed mutagenesis of the avrBsT, xopC and traF gene homologs was undertaken to verify their roles in Xanthomonas axonopodis pv. Phaseoli.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (133-XXXI f.)
  • Annexes : Bibliogr. f. 115-133

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