Modélisation des populations microbiennes en environnements variables

par Caroline Tolla

Thèse de doctorat en Biologie théorique

Sous la direction de Jean-Christophe Poggiale.


  • Résumé

    Les environnements naturels sont en général complexes, forcés par des perturbations en temps et espace qui peuvent influencer le devenir des populations considérées. Les modèles classiques analysant la dynamique microbienne ne sont pas appropriés à l’étude d’environnements naturels. Cette thèse développe une caractérisation réaliste du lien entre populations microbiennes et leur environnement à travers une approche mécaniste. Elle est basée sur la théorie du Budget Dynamique en Energie qui prend en compte la différence en composition d’un organisme et de sa ressource. De ces travaux découle un certain nombre d’idées générales sur (i) les interactions entre populations et leurs environnements; (ii) les problématiques de la modélisation et l’importance de l’approche suivie pour la construction du modèle. De plus, cette approche peut aider à la compréhension de l’état physiologique de l’individu et peut avoir un large champ d’application dans la modélisation des processus métaboliques.

  • Titre traduit

    Modelling microbial populations in variable environments


  • Résumé

    Natural environments are mostly complex, forced by perturbations in time and space that can influence the fate of the considered populations. Classical models analysing the microbial dynamics are not appropriated to the study of natural environments. This thesis expands on a realistic characterisation of the links between microbial populations and their environment through a mechanistic modelling approach. It is based on the Dynamics Energy Budget (DEB) theory which takes into account the difference between the organism and the resource composition. The work presented in this dissertation yields a number of general ideas (i) on the interactions between microbial populations and their environments; (ii) on the modelling problematic and the importance of the modelling approach. Furthermore, the mechanistic approach can help to understand the physiological state of the individual and can have a wide applicability in modelling metabolic processes.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (ii-150 p.)
  • Annexes : Bibliogr. : p.133-140

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  • Cote : 44537

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