Implication des singes amazoniens dans la circulation et l'évolution des arbovirus et herpesvirus

par Benoît de Thoisy

Thèse de doctorat en Microbiologie et virologie

Sous la direction de Mirdad Kazanji.

Soutenue en 2005

à Paris 7 .


  • Résumé

    La circulation d'arbovirus amazoniens: Dengue, Mayaro et Fièvre Jaune, a été étudiée dans une communauté de mammifères sauvages de Guyane. Le virus de la Dengue ne circule pas en cycle strictement forestier en Amérique du sud, mais les mammifères des zones périurbaines pourraient être des hôtes accidentels. Les singes seraient eux des réservoirs majeurs des virus de Mayaro et de la Fièvre Jaune. Toutes les autres espèces partageant les microhabitats des vecteurs seraient aussi susceptibles d'être infectées, et pourraient servir de réservoirs. L'ubiquité de ces virus peut être une adaptation aux contraintes écologiques du milieu amazonien, où les communautés de mammifères comprennent des espèces très diverses mais souvent peu abondantes. Or, dès que les habitats sont perturbés par les pressions anthropiques, cette diversité diminue fortement. Un spectre d'hôtes potentiels moins large favoriserait alors l'infection des espèces les plus compétentes, avec pour conséquence une augmentation de la circulation virale et de la virulence des souches, facteurs majeurs à l'origine de l'émergence de ces pathologies. Quatre nouveaux Lymphocryptovirus ont été partiellement séquencés chez les Platyrrhiniens. Les relations phylogéniques croisées entre ces virus et leurs hôtes permettent de conforter en partie les processus de coévolution, à l'origine de la diversification des Herpesviridae. La cospéciation est observée entre les virus et les Platyrrhiniens et Catarrhyniens, mais n'est que partiellement retrouvée à un niveau inférieur. La phylogénie des singes sudaméricains est cependant encore débattue, la diversification des herpesvirus pourrait aider à comprendre celle de leurs hôtes.

  • Titre traduit

    Roles of amazonian primates in circulation and evolution of arboviruses and herpesviruses


  • Résumé

    Circulation of three amazonian arboviruses: Dengue, Mayaro Fever, Yellow Fever, was investigated in a community of wild forest mammals in French Guiana. Dengue virus does not have any strictly sylvatic cycle in South America, but fauna in periurban areas may act as incidental hosts. On the other hand, monkeys are main hosts for Mayaro and Yellow Fever viruses. But most of other species using the microhabitat of potential vectors may also be infected, and could serve as reservoir. Ubiquity of these viruses may be an adaptation to ecological constraints of amazonian ecosystems, where mammal communites are highly diverse, with low densities of many species. Then, as soon as habitats are facing anthropogenic pressures, this diversity decreases: a lower number of potential hosts may favor infection of most efficient reservoir species. The direct consequence is the increase of virus circulation and virulence, expected to directly contribute to disease emergence. Four new Lymphocryptovirus have aIso been identified and partially sequenced in Platyrrhines. Crossing phylogenetic relationships of viruses and their hosts partially support coevolution process, a major feature in Herpesviridae diversification. Cospeciation is oberved between virus and Platyrrhines vs. Catarrhines, but not fully at more recent evolution steps. Nevertheless, phylogeny of neotropical monkeys remains unclear, and diversification of herpesvirus may help to understand taxonomic relationships between their host species.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (198 f.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : 339 réf.

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