Construction et applicabilité théoriques en chimie des protéines (1960-1990) : essai épistémologique et historique

par Frederic Wieber

Thèse de doctorat en Epistémologie, histoire des sciences et techniques

Sous la direction de Claude Debru.

Soutenue en 2005

à Paris 7 .


  • Résumé

    Les protéines ont été étudiées à partir du 19° siècle par des méthodes chimiques diverses (chimie analytique, organique, physico-chimie). Notre étude se propose de comprendre l'application à ces objets moléculaires spéciaux de concepts et pratiques, plus récents, de chimie théorique et computationnelle. Ce processus de reconfiguration du champ de la chimie des protéines, que nous suivons entre 1960 et 1990, est lié au développement des méthodes de mécanique et de dynamique moléculaires. Nous discutons des origines de celles-ci (spectroscopie IR, stéréochimie des molécules organiques et physique statistique des liquides), et de la façon dont ces méthodes ont été appliquées au cas des macromolécules protéiques. Au cours de cette analyse historique, nous étudions précisément les modélisations et simulations construites dans le corpus de textes scientifiques que nous avons constitué. Pour espérer comprendre la spécificité épistémologique de cette reconfiguration en chimie des protéines, nous discutons préalablement des concepts de modèle et de simulation, tels qu'ils ont été analysés en philosophie des sciences. L'analyse historique mêlée à l'analyse épistémologique permet alors de comprendre comment la tradition de recherche étudiée se construit entre problème de calculabilité et nécessaire intégration aux connaissances protéiques précédemment instituées. Nous décrivons donc comment un savoir de nature théorique a pu être construit en chimie des protéines, dans un contexte d'application théorique problématique et de complexité computationnelle. Notre travail offre ainsi une étude de cas sur l'impact de l'ordinateur sur les sciences dans la seconde moitié du vingtième siècle.


  • Résumé

    Proteins were studied starting from the19th century by various chemical methods (analytical and organic chemistry, physical chemistry). Our study wants to understand the pplication to these special molecular objects of the more recent concepts and practices of theoretical and computational chemistry. This reconfiguration process of the field of protein chemistry, which we follow between 1960 and 1990, is related to the development of the methods of molecular mechanics and molecular dynamics. We discuss the origins of those methods (IR spectroscopy, stereochemistry of organic molecules and statistical physics of liquids) and the way these methods were applied to the special case of protein macromolecules. During this historical analysis, we precisely study the models and simulations built in the scientific corpus of texts we constituted. To understand the epistemological specificity of this reconfiguration in protein chemistry, we discuss beforehand the concepts of model and simulation, such as they are analyzed in the philosophy of science. The historical analysis mixed with the epistemological analysis then makes il possible to understand how the studied research tradition is built between roblem of calculability and necessary integration to proteinic knowledge previously instituted. We thus describe how a knowledge of theoretical nature could be built in protein chemistry, in the context of a problematic theoretical application and of computational complexity. Our work thus offers a case study on thé impact of thé computer on sciences in second naïf of thé twentieth century.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (607 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : 441 ref.

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  • Bibliothèque : Université Paris Diderot - Paris 7. Service commun de la documentation. Bibliothèque Universitaire des Grands Moulins.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TL (2005) 035

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  • Cote : MC 9059
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