Caractérisation génétique d'une tumeur dermique : le dermatofibrosarcoma protuberans

par Georges Maire

Thèse de doctorat en Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie

Sous la direction de Florence Pedeutour.

Soutenue en 2005

à Nice .


  • Résumé

    Le Dermatofibrosarcoma Protuberans (DP) est une tumeur dermique rare de malignité intermédiaire. Les travaux réalisés antérieurement au laboratoire avaient identifié de façon préliminaire un gène de fusion dans cette tumeur. Grâce à la mise au point d’une RT-PCR multiplexe et de FISH bicolore adaptées aux prélèvements fixés et inclus en paraffine, nous avons étudié au niveau moléculaire la plus grande série de cas de DP à ce jour. Nous montrons que le gène de fusion COL1A1-PDGFB est pathognomonique du DP. De plus, nous l’avons détecté dans des tumeurs proches comme le fibroblastome à cellules géantes, la tumeur de Bednar. Ces résultats nous ont permis d’identifier une nouvelle famille de tumeur définie par la présence moléculaire du gène de fusion COL1A1-PDGFB. La variabilité de la localisation du point de cassure dans COL1A1 n’est pas corrélée avec des paramètres cliniques ou histologiques. Nous avons notamment identifié pour la première fois le gène de fusion dans des cas congénitaux de DP. De plus, une étude par cytogénétique et RT-PCR nous a montré que la forme de l’anomalie chromosomique est indépendante de la localisation du point de cassure dans COL1A1. En revanche, la forme de l’anomalie chromosomique est corrélée avec l’âge du patient. Les cas pédiatriques présentent exclusivement des translocations alors que les anneaux sont observés chez les adultes. Au cours de notre étude rétrospective, nous avons identifié 13 % de cas de DP. Nous avons identifié dans un cas de DP une nouvelle translocation t(5 ;8) dont notre étude montre l’implication des gènes PTK2B et PDGFRB. PTK2B semble être le lieu d’un point de cassure. Le gène PDGFRB semble être dérégulé puisque nous avons observé un niveau de transcription anormalement élevé similaire au niveau mesuré dans les DP avec le gène de fusion COL1A1.

  • Titre traduit

    Genetic characterization of a dermic tumor : dermatofibrosarcoma protuberans


  • Pas de résumé disponible.


  • Résumé

    Dermatofibrosarcoma Protuberans (DP) is a rare slow-growing infiltrating dermal neoplasm of intermediate malignancy. At the cytogenetic level, DP cells are characterized by either supernumerary ring chromosomes or t(17;22) that are most often unbalanced. Both the rings and linear der(22) contain a specific fusion of COL1A1 with PDGFB. Whereas rings have been mainly observed in adults, translocations have been reported in all paediatric cases. DP is therefore a unique example of tumor in which (i) the same molecular event occurs either on rings or linear translocation derivatives, and (ii) the chromosomal abnormalities display an age-related pattern. In all DP cases that underwent molecular investigations, the breakpoint localization in PDGFB was found to be remarkably constant in exon 2. In contrast, the COL1A1 breakpoint was found to be variably located within the exons of the alpha-helical coding region (exons 6-49)/ No preferential COL1A breakpoint and no correlation between the breakpoint location and the age of the patient or any clinical or histological particularity have been described. Congenital case as well as paediatric or adult case presented all the same COL1A1-PDGFB rearrangement. The COL1A1-PDGFB fusion is detectable by multiplex RT-PCR or dual colour FISH experiment adapted to fixed and paraffin embedded tissues. In approximately 13 % of DP cases, the COL1A1-PDGFB fusion is not found, suggesting that genes other than COL1A1 or PDGFB might be involved in a subset of cases. We identified a DP without the COL1A1-PDGFB fusion gene. We observed a t(5;8) where PTK2B gene was found rearranged. In addition, we detected a high level of PDGFRB transcription in the case.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (149 f.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. f. 126-149. Résumé en français

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  • Bibliothèque : Université Nice Sophia Antipolis. Service commun de la documentation. Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 05NICE4004
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