Approches métagénomiques pour l'analyse des diversités génétique et chimique de métabolites secondaires : étude des PKS de type 1 d'origine bactérienne

par Cyrille Jarrin

Thèse de doctorat en Écologie microbienne

Sous la direction de Timothy Vogel.

Soutenue en 2005

à Lyon 1 .


  • Résumé

    La métagénomique permet d'accéder aux informations génétiques des bactéries non-cultivées (99% des bactéries). La diversité chimique des principes actifs pharmaceutiques produits par les bactéries cultivées et la diversité génétique des voies de biosynthèse correspondantes, suggèrent que la metagénomique amènera à la découverte de substances originales par l'exploitation de nouvelles voies de biosynthèse. Les polykétides synthases (PKS) étant retenues comme cible, une banque metagénomique a été construite à partir de grands fragments d'ADN de bactéries environmentales et des méthodes de criblage génétique ont été développées pour isoler de nouvelles PKS. Après avoir démontré leur originalité et leur unicité, l'expression de ces voies par un hôte approprié a conduit à la détection de composés antibactériens. L'analyse des diversités génétique et chimique révèle que, malgré la proximité de certains domaines génétiques, les polykétiques correspondants diffèrent significativement


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Informations

  • Détails : 1 vol. (128 f.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : 205 réf. bibliogr.

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université Claude Bernard (Villeurbanne, Rhône). Service commun de la documentation. BU Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : T50/210/2005/216bis
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