Structure, régulation, expression et polymorphismes du gène CAST codant la calpastatine bovine

par Peggy Raynaud

Thèse de doctorat en Biologie - Sciences - Santé

Sous la direction de Hubert Leveziel.

Soutenue en 2005

à Limoges , en partenariat avec Université de Limoges. Faculté des sciences et techniques (autre partenaire) .


  • Résumé

    La calpastatine est l'inhibiteur spécifique des calpaïnes ubiquitaires calcium-dépendantes, la µ- et la m-calpaïne. Le système calpaïnes/calpastatine est impliqué dans un grand nombre de processus physiologiques et pathologiques ainsi que dans la maturation de la viande bovine. Connaissant l'importance économique de la race bovine pour les professionnels de la viande, il apparaît important de clarifier le mode d'expression de la calpastatine. Nous avons établi la structure du gène codant la calpastatine bovine et démontré l'existence de quatre promoteurs dirigeant l'expression de quatre Types de transcrits (Type I, II, III et IV) différant par leur partie 5'. Les transcrits de Type I, II et III sont ubiquitaires alors que le Type IV est spécifique des testicules. Nous avons pu également démontré que le transcrit de Type III est associé à 3 extrémités 3' UTR de longueurs différentes. Grâce à l'utilisation de sérums dirigés contre des régions peptidiques spécifiques, la correspondance entre les transcrits de Type I, II et III et les isoformes protéiques a été établie. Enfin, deux nouveaux SNPs situés dans l'intron 8 et l'exon 30 ont été détectés. Ces deux SNPs ainsi que deux autres et un microstallite, déjà décrits, ont été génotypés sur une population de 82 individus Charolais et les haplotypes correspondants ont été déterminés

  • Titre traduit

    Structure, regulation, expression and polymorphisms of the bovine calpastatin gene (CAST)


  • Résumé

    Calpastatin is a specific endogenous inhibitor of the ubiquitous calcium dependent proteinases, µ- and m-calpain. The calpain-calpastatin system is involved in various physiological and pathological processes as well as in the tenderisation process of bovine meat. Despite all the available informations concerning calpastatin, little is known about how this gene is regulated at the transcriptional and translational level, especially in bovine. Regarding the economic importance of that species for livestock industries, it appears clearly important to clarify some of the factors related to calpastatin gene expression. We established the bovine calpastatin gene structure and determined that four promoters direct the expression of four Types of transcripts (I, II, III and IV) differing in their 5' ends. Type I, II and III mRNA transcripts are ubiquitous while Type IV is testis-specific. We also demonstrate that Type III transcript is associated with three 3' UTR differing by their size. Using specific anti-peptide anti-sera, a correspondance between the Type I, II and III mRNA transcripts and calpastatin isoforms has been established. Finally, two new SNPs in intron 8 and exon 30 were detected. These two SNPs as well as two others and a microsatellite, previously described, were genotyped in a population of 82 Charolais individuals and the corresponding haplotypes were established

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Informations

  • Détails : 1 vol. (156 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. p. 139-156

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  • Bibliothèque : Université de Limoges (Section Sciences et Techniques). Service Commun de la documentation.
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