Implication des facteurs sigma de groupes 1 et 2 dans la régulation globale chez Synechocystis PCC6803

par Sylvain Lemeille

Thèse de doctorat en Biologie

Sous la direction de Johannes Geiselmann.

Soutenue en 2005

à l'Université Joseph Fourier (Grenoble) .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    Les organismes vivants à la surface de la Terre subissent un changement environnemental important quotidien du fait de la rotation terrestre. Certains organismes ont mis au point un mécanisme interne de régulation leur permettant d'anticiper ces changements récurrents. Ce mécanisme s'appelle le cycle circadien. Chez les cyanobactéries, les cycles circadiens ont une importance capitale car ils contrôlent la quasi-totalité du génome. Comme pour tous les microorganismes, l'acclimatation et la réponse aux stimuli environnementaux sont le plus souvent dues à des activations ou des répressions de certains gènes au niveau transcriptionnel. Les sous-unités sigma de l'ARN polymérase sont des régulateurs globaux de la transcription. La cyanobactérie Synechocystis PCC6803 possède quatre facteurs sigma de groupe 2 et un facteur sigma de groupe 1. Son programme transcriptionnel es largement modulé par ces sous-unités. Dans ce travail, nous montrons que les cinq facteurs sigma de groupe 1 et de groupe 2 de Synechocystis PCC6803 sont reliés les uns aux autres par un réseau de régulation. La conséquence de ce réseau est qu'ils agissent en consortium dans la réponse aux stress environnementaux. Ce réseau capte le signal circadien et le répercute ensuite à l'ensemble du génome. En effet, nous montrons que dans les conditions habituelles d'étude des cycles circadiens, tout le génome de Synechocystis PCC6803 est concerné. Enfin, nous discutons la signification évolutive du cycle circadien chez les cyanobactéries : s'agit-il d'une observation imputable aux conditions expérimentales? Ou le cycle circadien peut-il être réellement considéré comme u système de régulation par défaut?


  • Pas de résumé disponible.

  • Titre traduit

    Implication of group 1 and 2 sigma factors in the global regulation of Synechocystis PCC6803


  • Résumé

    Ali living organisrns on the Earth undergo an important daily environmental change due to the terrestrial rotation. Most organisms have developed an internaI mechanism of regulation in order to anticipate these recurring changes. This mechanism is called the circadian cycle. In cyanobacteria, the circadian cycle seerns to be particularly important because it controls almost the entire genome. As for all micro-organisms, the acclimatization and the response to the environmental stimuli are generally due to activations or repressions of gene expression. The sigma sub-units of RNA polymerase are global regulators of the transcription. The cyanobacterium Synechocystis PCC6803 possesses four group-2 and one group-I sigma factor. Its transcriptional prograrn is largely modulated by these factors. Ln this work we show that the five group 1 and 2 sigma factors of Synechocystis PCC6803 are connected to each other by a regulation network. As a consequence they act as a consortium in order to respond to environmental stresses. This network also collects the circadian signal and then transmits the circadian time to the entire genome. We show that under the usual conditions of study of the circadian cycles, the entire genome of Synechocystis PCC6803 is concerned. We finally discuss the evolutionary significance of the circadian cycle in cyanobacteria : should it be considered as a consequence of the experimental conditions, or should the circadian cycle be regarded as a default system of regulation?

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Informations

  • Détails : 1 vol. (184 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. p.149-184

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  • Bibliothèque : Service interétablissements de Documentation (Saint-Martin d'Hères, Isère). Bibliothèque universitaire de Sciences.
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : TS05/GRE1/0159
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  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TS05/GRE1/0159/D
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