Sélection et caractérisation d'aptamères inhibiteurs de l'ARN polymérase ARN dépendante du virus de l'hépatite C

par Pantxika Bellecave

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et médicales. Biologie - Santé

Sous la direction de Thérèse Astier Gin.

Soutenue en 2005

à Bordeaux 2 .


  • Résumé

    L'infection par le virus de l'hépatite C (VHC) est un problème majeur de santé publique. Le traitement actuel n'étant efficace que dans 50 % des cas, le développement de nouveaux traitements anti-VHC est nécessaire. L'ARN polymérase ARN dépendante (RdRp) du VHC est une cible de choix puisqu'elle est nécessaire à la réplication du virus. En utilisant une stratégie combinatoire (SELEX), nous avons sélectionné des aptamères ADN se fixant à la RdRp du VHC. Parmi ces aptamères, 3 présentaient un effet inhibiteur sur la réplication in vitro. Pour 2 d'entre eux, la capacité à se fixer et à inhiber la RdRp a été associée à leur région variable. Ces 2 aptamères, qui présentent des structures secondaires différentes, inhibent spécifiquement la RdRp du VHC par des mécanismes distincts : alors que l'un inhibe l'élongation de la synthèse d'ARN, l'autre agit principalement sur l'initiation. Leur effet sur la réplication dans un contexte cellulaire a aussi été étudié dans le système réplicon.

  • Titre traduit

    Selection and characterization of aptamers that inhibit hepatitis C virus RNA dependent RNA polymerase


  • Résumé

    Hepatitis C (HCV) infection is a major health problem worldwide. The current therapy is not effective for half of treated patients thus, the development of new and specific drugs are urgently needed. Among the viral functions essential for viral replication, one of the most attractive targets for the development of drugs is the RNA dependant RNA polymerase (RdRp). Using a combinatorial approach (SELEX), DNA aptamers which bind specifically the HCV RdRp were selected. Three of these aptamers are able to inhibit the RNA synthesis in vitro. The binding and the inhibitory potential of 2 of these aptamers were associated with the random region. These aptamers, which display different secondary structures, inhibit specifically HCV RdRp by 2 distinct mechanisms : one is able to inhibit elongation whereas the other acts predominantly on initiation. The effect of the aptamers on HCV replication in a cellular context was studied with replicon system.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (163 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. 395 réf.. Annexes

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  • Bibliothèque : Université de Bordeaux. Direction de la Documentation. Bibliothèque des Sciences du Vivant et de la Santé.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : CMTB 2005-1289
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