Analyse de la structure des réseaux métaboliques : application au métabolisme énergétique mitochondrial

par Sabine Pérès

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et médicales. Biologie - Santé

Sous la direction de Jean-Pierre Mazat.

Soutenue en 2005

à Bordeaux 2 .


  • Résumé

    L'analyse des voies métaboliques est une étape essentielle pour étudier les comportements d'un réseau métabolique. Une approche théorique telle les modes élémentaires permet d'analyser les propriétés structurales du réseau. Leur recherche dans un réseau métabolique est souvent caractérisée par une explosion combinatoire de leur nombre. Nous avons appliqué ce formalisme à trois réseaux métaboliques : le réseau mitochondrial énergétique du muscle, du foie et de la levure. Nous avons ensuite construit une méthode de classification des modes élémentaires afin d'analyser les résultats obtenus. Cette méthode basée sur l'agglomération de motifs communs nous permet d'interpréter de grands ensembles de modes élémentaires, de retrouver les fonctions biologiques partagées par ces groupes et de mettre en évidence des liens entre les réactions.

  • Titre traduit

    Structural Analysis of Metabolic Netwoks : Application to mitochondrial energic Metabolism


  • Résumé

    Metabolic pathway analysis is essential to study metabolic network behaviour. Theorical approach like elementary flux mode enables to study the network structural properties. Their determination lead to combinatorial explosion of their number when the network is complex. We have applied this formalism to three metabolic networks : mitochondrial energetic metabolism of muscle, liver and yeast. We have elaborate a classification method of elementary modes to analyze the obtained results. This method, based on an agglomeration of commun motifs allows us to interpret classes of elementary modes, to find their biological meaning and to express links between reactions.

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Informations

  • Détails : 1 vol.(132 f.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. 77 réf.

Où se trouve cette thèse ?

  • Bibliothèque : Université de Bordeaux. Direction de la Documentation. Bibliothèque des Sciences du Vivant et de la Santé.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : CMTB 2005-1282
  • Bibliothèque : Bibliothèque interuniversitaire de santé (Paris). Pôle pharmacie, biologie et cosmétologie.
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : MFTH 6982
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