Etude de l'évolution de séquences mitochondriales chez deux champignons basidiomycètes du genre Agrocybe : origine et érosion d'un gène rare (polB) codant pour une ADN polymérase de la famille B, transferts latéraux d'introns et variabilité de séquences microsatellites

par Bello Mouhamadou

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et médicales. Biologie - Santé

Sous la direction de Gérard Barroso.

Soutenue en 2005

à Bordeaux 2 .


  • Résumé

    Trois types de séquences mitochondriales ont été clonés chez 2 basdiomycètes du genre Agrocybe. - Un gène rare codant pour une ADN polymérase (famille B). Les 2 copies d'A. Chaxingu ont été comparées à celles d'A. Aegerita (Aa-polB potentiellement fonctionnel et son paralogue érodé). Ces copies sont reliées aux plasmides linéaires, suggérant qu'elles proviendraient de l'intégration dans l'ADNmt d'une copie plasmidique, suivie par son érosion puis son élimination. - Un gène mitochondrial hautement conservé (cob). Ce gène varie au niveau de ses introns. Ces introns codant de groupe 1 seraient issus de transferts latéraux entre champignons de divisions éloignées. - Une séquence intergénique, avec 4 loci microsatellites et possédant des similitudes d'organisation avec la région contrôle de l'ADNmt des animaux. Elle pourrait constituer une "ori" de l'ADNmt fongique. Les variations intraspécifiques de ces loci suggèrent qu'ils pourraient être performants pour la caractérisation des souches.

  • Titre traduit

    Molecular evolution of the mitochondrial genome of two Agrocybe species : origin and erosion of a rare polB gene encoding a family B DNA polymerase, lateral transfers of group I introns and variability of microsatellites


  • Résumé

    Three kinds of mitochondrial sequences have been cloned in 2 basidiomycetes of the Agrocybe genus : - An unusual gene encoding a family B DNA polymerase. Both A. Chaxingu copies have been compared to those of A. Aegerita (Aa-polB potentially functional and its disrupted paralog). All copies are related to linear plasmids, suggesting that they result from the integration into the mtDNA of plasmid sequences, then affected by deletions to their erosion, and to their elimination. - A highly conserved mitochondrial gene (cob) varying at the level of its introns. These Group I introns, encoding Homing endonucleases, would result from lateral transfers between fungi from distant divisions. - An intergenic sequence, which accumulates microsatellite loci, possesses a similarity of organization with the mtDNA control region of animals and thus, could contain an "ori" of Agrocybe mtDNA. The intraspecific variability of these loci suggests that they could be used in strain fingerprinting.

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Informations

  • Détails : 1 vol.(116 f.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. 203 réf.

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  • Bibliothèque : Université de Bordeaux. Direction de la Documentation. Bibliothèque des Sciences du Vivant et de la Santé.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : CMTB 2005-1277
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