Compétition entre Pleurotus ostreatus et Trichoderma sp. En culture sur paille de blé : rôle des communautés bactériennes du substrat et des laccases de Pleurotus

Competition between Pleurotus ostreatus and Trichoderma sp. On wheat straw culture: role of bacterial communities and of laccases produced by Pleurotus

• Auteur / Autrice : Marnyye Angélica Velazquez Cedeno
• Direction : Jean-Michel Savoie
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie des populations et écologie
• Date : Soutenance en 2005
• Etablissement(s) : Aix-Marseille 3

Mots clés

Mots clés contrôlés

Transcription génétique

PCR (génétique)

Trichoderma

Pleurotes

Antibiose

Bactéries

Résumé

La préparation d'un substrat de culture électif est importante afin de favoriser la croissance du champignon comestible Pleurotus ostreatus, et limiter l'implantation de ses antagonistes fongiques. L'ensemble des analyses de PCR-DGGE et de dénombrements microbiens montre que la structure de la communauté bactérienne est modifiée en fonction du traitement employé, l'espèce de Pleurotus inoculée, l'introduction de microorganismes inhibiteurs de Trichoderma sp. Et l'ajout de Compostzyme®. Ces changements dans la structure des communautés bactériennes influencent la compétition entre P. Ostreatus et Trichoderma sp. Les principaux microorganismes assurant l'électivité sont ceux qui appartiennent au genre Bacillus dont Paenibacillus polymyxa. Une première approche sur les mécanismes d'induction d'expression de gènes de laccase de P. Ostreatus a été mise en œuvre en démontrant que la transcription du gène poxa1b est modifiée par T. Longibrachiatum tandis que l'expression du gène pox1 est modifiée par P. Polymyxa.

The preparation of selective substrates is very important in order to favor the growth of the edible fungus Pleurotus ostreatus and to suppress its fungal competitors. Shifts in the substrate bacterial community structure were detected by PCR-DGGE and plate count analyses, depending on the treatment used, the inoculated Pleurotus species, the introduction of microorganisms inhibitors of Trichoderma and the addition of Compostzyme®. These shifts affect the competition between P. Ostreatus and T. Longibrachiatum. Microorganisms belonging to the group of Bacillus, such as Paenibacillus polymyxa. , and actinomycetes are involved in substrate selectivity, but little taxonomic diversity was observed. This study is a first attempt to analyze the induction of P. Ostreatus laccase gene expression. We observed that the transcription of poxa1b gene is modified by T. Longibrachiatum whereas the expression of pox1 gene is modified by P. Polymyxa.