Approche éco-génomique de la biodiversité : phylogéographie comparée des cyprinidés européens et analyse spatio-temporelle des processus introgressifs entre deux espèces de chondrostomes

par Caroline Costedoat

Thèse de doctorat en Eco-génomique

Sous la direction de Rémi Chappaz et de André Gilles.


  • Résumé

    Un peuplement n'est pas une entité figée et stable, mais une communauté en perpétuel renouvellement désormais soumis à l'action directe de l'homme. La phylogéographie permet de décrire et d'expliquer la répartition géographique des taxa. Bien que chaque espèce présente une histoire qui lui est propre, l'augmentation du nombre d'études a permis l'émergence de certains processus qui tendent à se généraliser. Nous avons pu mettre en évidence certains biais, indispensables à résoudre avant toute tentative de phylogéographie comparée. Chez les Teleostei en général et les Cyprinidae en particulier, les phénomènes d'hybridations sont fréquents. Suite à la vision géographique de la spéciation, abordée par l'approche phylogéographique, nous nous sommes intéressés aux mécanismes de la spéciation par l'étude de la zone hybride entre deux espèces de Chondrostomes. Celle-ci caractérisée par une hybridation introgressive bi-directionnelle suit le modèle des Nouveautés Evolutives (Arnold 1997), en combinant la présence de combinaisons génomiques environnement-indépendantes et environnement-dépendantes. Nous avons pu montrer l'importance de combiner les approches moléculaire et morphologique dans le décryptage des processus d'hybridation en permettant d'aborder les relations génome-environnement. Les phénomènes d'introgression conduisent à un débat encore délicat concernant le statut de protection des différentes entités participant à de tels processus. Cette approche éco-génomique réalisée tant au niveau populationnel que spécifique illustre la complexité des interactions existant entre gènes et milieux

  • Titre traduit

    Eco-genomic approach of the biodiversity : compared phylogeography of european cyprinids and space & time analyse of introgressive processes between two chondrostoma species


  • Pas de résumé disponible.


  • Résumé

    A settlement is not a fixed and stable entity, but a community in perpetual renewal, subjected now to the direct action of human. The phylogeography try to describe and explain the geographical distribution of taxa. Although each species presents its own story, the increasing number of studies allowed the emergence of some processes. We could highlight certain bias, essential to resolve before any attempt to perform compared phylogeography. In Teleostei in general and in Cyprinidae in particular, hybridization phenomena are an ongoing process. Considering a geographical view of the speciation, approached by the phylogeographic part of the manuscript, we were then interested in mechanisms of speciation and we focused on the hybrid zone between two Chondrostoma species. This hybrid zone is characterized by a bidirectional introgressive hybridization that follows the Evolutionary Novelty model (Arnold 1997), combining the presence of environment-independent and environment-dependent genomic combinations. Furthermore, we have shown that combining the molecular and the morphological approach in the deciphering of hybridization processes is indispensable. Indeed, these combined approaches notably allowed to establish genome-environment relations. The introgression phenomena lead to a still unresolved debate concerning the protection status of the various entities taking part in such processes. This eco-genomic approach, carried out twice at the species level and at the population level, illustrates the complexity of the interactions existing between genes and environment

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Informations

  • Détails : 1 vol. (263 p.)
  • Annexes : Bibliographie p. 238-256

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  • Bibliothèque : Université d'Aix-Marseille (Marseille. St Charles). Service commun de la documentation. Bibliothèque universitaire de sciences lettres et sciences humaines.
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