Etude fonctionnelle de TFIIH et des mécanismes de transcription et de réparation de l'ADN

par Alexandre Tremeau-Bravard

Thèse de doctorat en Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie

Sous la direction de Jean-Marc Egly.

Soutenue en 2004

à Strasbourg 1 .


  • Résumé

    La régulation de l'expression des gènes et la réparation de l'ADN sont deux mécanismes essentiels à la survie de la cellule. La transcription des gènes de classe II codant pour les protéines est un mécanisme complexe faisant intervenir une myriade de protéines dont l'ARN polymérase II (ARNP II) et six facteurs généraux de la transcription (TFIIA, B, D, E, F et H). La réparation par excision de nucléotides (NER) permet l'élimination des lésions distordant l'ADN, c'est un mécanisme crucial pour le maintien de l'information génétique. Il fait également intervenir plus d'une vingtaine de protéines qui, pour certaines, se retrouvent mutées chez les patients atteints de maladies génétiques rares. Le facteur général de transcription TFIIH joue aussi un rôle dans l'étape d'ouverture de l'ADN autour de la lésion lors de la NER. Au cours de mon travail doctoral, j'ai entrepris dans un premier temps de détailler le rôle intrinsèque des différentes sous-unités du facteur TFIIH, et plus particulièrement de la sous-unité p44. J'ai ainsi pu montrer que la partie carboxy-terminale de cette protéine jouait un rôle dans la cohésion du complexe TFIIH mais aussi dans son activité d'échappée du promoteur lors de l'initiation de la transcription. Puis, dans un second temps, je me suis intéressé au mécanisme reliant la transcription à la réparation, nommé transcription couplée à la réparation. J'ai ainsi pu montrer qu'une ARNP II bloquée par une lésion cisplatine sur le brin transcrit de l'ADN se retrouve éjectée de l'ADN de façon ATP mais non réparation dépendante.

  • Titre traduit

    Functional study of TFIIH and the mechanisms of transcription and DNA repair


  • Résumé

    Genes regulation and DNA repair are two processes vital to cell survival. Transcription of class II genes (mostly protein coding genes) is a complex process involving the functions of many proteins, among them the RNA polymerase II (RNAP II) and six general transcription factors (TFIIA, B, D, E, F and H). Nucleotide excision repair (NER) is a mechanism whereby DNA lesions are eliminated. It's a key mechanism for the maintenance of genetic information. More than twenty proteins participate in this reaction. Mutation in some of them give rise to DNA repair genetic disorders. The general transcription factor TFIIH plays also a role in DNA melting around the lesion during the NER reaction. During my PhD study, I first study the role of different TFIIH subunits, especially the p44 subunit. I was able to show that the carboxy-terminal domain of this protein is important for TFIIH cohesion but also promoter escape activity of TFIIH. Then I focused my attention on the mechanism that link transcription and DNA repair: transcription coupled repair. I was able to show that an RNAP II blocked by a cisplatin lesion on the transcribed DNA strand is ejected from the template in an ATP but not a repair dependent manner.

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Informations

  • Détails : Pagination multiple [137] f.
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. f. 120-136

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  • Bibliothèque : Université de Strasbourg. Service commun de la documentation. Bibliothèque Danièle Huet-Weiller.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : Th.Strbg.Sc.2004;4561
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