Étude structurale et dynamique des interactions entre le récepteur 5-HT 4 humain et ses ligands par modélisation moléculaire

par Lucie Rivail

Thèse de doctorat en Chimie thérapeutique

Sous la direction de Sames Sicsic.


  • Résumé

    Le récepteur sérotoninergique 5-HT4 appartient à la famille des RCPG et est exprimé dans de nombreux tissus, dans lesquels il contrôle diverses fonctions physiologiques. Un dysfonctionnement du récepteur 5-HT4 pourrait intervenir dans plusieurs pathologies pour lesquelles aucune thérapie n'est efficace. Afin de mieux comprendre le mode de fixation des ligands sur le récepteur 5-HT4, nous avons entrepris une étude structurale du récepteur. Par homologie avec la structure de la rhodopsine bovine, nous avons modélisé le récepteur 5-HT4 dans le vide. Par mutagénèse dirigée, nous avons analysé les interactions entre le récepteur et ses ligands, en particulier dans une poche hydrophobe du site de liaison. Nous avons ensuite placé le récepteur dans un modèle de bicouche lipidique et fait une dynamique moléculaire de plusieurs ns. Enfin, nous avons appliqué les méthodes de perturbations d'énergie libre sur notre modèle, afin de relier les constantes d'affinité à la différence d'énergie libre.


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Informations

  • Détails : 1 vol. (203 f.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. f. 186-203

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  • Bibliothèque : Université Paris-Sud (Châtenay-Malabry, Hauts-de-Seine). Service Commun de la Documentation. Section Pharmacie.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 04PA114842 B
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