Cartographie génétique et étude de QTL conférant la résistance au nématode à kyste Globodera pallida (Stone) chez la pomme de terre (Solanum tuberosum ssp. Tuberosum L. )

par Bernard Caromel

Thèse de doctorat en Sciences biologiques. Génétique

Sous la direction de Alain Palloix et de Véronique Lefebvre.

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  • Résumé

    Iln'existe pas de sources de résistance de niveau satisfaisant au nématode à kyste Globodera pallida dans l'espèce de pomme de terre cultivée Solanum tuberosum, et la plupart des sources de résistance connues, originaires d'espèces sauvages de Solanum tubéreuses, sont à déterminisme oligogénique ou polygénique Le déterminisme génétique de la résistance à G. Pallida a été étudié dans deux descendances diploïdes de pomme de terre. Les parents sensibles sont des clones dihaploïdes de S. Tuberosum (tbr). Les parents résistants sont des clones des espèces sauvages S. Spegazzinii (spg) et S. Sparsipilum (spl). Sept QTL (Quantitative Trait Loci) de résistance ont été cartographiés : deux sur les chromosomes V et XI de spl, trois sur les chromosomes V, VI, et XII de spg, et deux sur les chromosomes VIII et XI de tbr. Les deux QTL cartographiés sur les chromosomes V de spl et spg montrent un effet majeur (R² = 76 % et 48 %), les cinq autres QTL détectés montrent un effet mineur (R² compris entre 4 et 13 %). La résistance conférée par chacun des QTL provoque une inversion du sexe-ratio dans la population de G. Pallida en faveur des mâles. Quand les deux QTL originaires de spl sont présents ensembles dans un même clone, ils induisent une nécrose autour des nématodes, et un arrêt du développement de la majorité d'entre eux. Le QTL à effet majeur originaire de spl confère un niveau de résistance différent selon la population de G. Pallida étudiée. Le QTL mineur originaire de spl, et l'association d'au moins deux QTL, ne montrent pas d'effet "population-spécifique".

  • Titre traduit

    Genetic mapping and fonctional analysis of QTLs (Quantitative Trait Loci) confering the resistance to the cyst nematode Globodera pallida (Stone) in potato (Solanum tuberosum ssp. Tuberosum L. )


  • Résumé

    No high level resistance to the cyst nematode Globodera pallida is available in the cultivated potato species Solanum tuberosum. Most of the resistance sources, originating from wild potato species, are oligogenic or polygenic. The genetic determinism of the resistance to G. Pallida was studied in two potato diploid progenies. Susceptible parents are dihaploid clones from S. Tuberosum (tbr). Resistant parents are clones from the wild diploid species S. Spegazzinii (spg) et S. Sparsipilum (spl). Seven resistance QTLs (Quantitative Trait Loci) were mapped: two on spl chromosomes V and XI, three on spg chromosomes V, VI, and XII, and two on tbr chromosomes VIII and XI. The two QTLs mapped on spl and spg chromosomes V, showed a major effect (R²=76% and 48%). The five other QTLs showed a minor effect (R² between 4 and 13%)The resistance conferred by each QTL provokes a shift of the sex-ratio toward males. The joint presence of the two QTLs from spl, provokes a necrotic reaction around nematodes, and the blocking of the development for most of them. The major effect QTL from spl confers a different resistance level depending on the G. Pallida population. The minor effect QTL from spl, and the joint presence of at least two QTLs don't show a population-specific effect. The resistance QTLs to G. Pallida are going to be integrated in breeding programs, thanks to PCR markers developed during this work. QTLs will be associated in taking account the resistance level against the different G. Pallida populations.

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Informations

  • Détails : 133 p.
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. p. 114-133

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  • Bibliothèque : Université Paris-Sud (Orsay, Essonne). Service Commun de la Documentation. Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : 0g ORSAY(2004)257
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