Recherche de nouveaux gènes responsables de rétinopathies pigmentaires

par Cécilia Maubaret

Thèse de doctorat en Sciences chimiques et biologiques pour la santé. Neurosciences

Sous la direction de Christian Hamel.

Soutenue en 2004

à Montpellier 1 , en partenariat avec Université de Montpellier I. Faculté de médecine (autre partenaire) .


  • Résumé

    LE BUT DE CE TRAVIL A ETE D'IDENTIFIER DE NOUVEAUX GENES RESPONSABLES DES RETINOPATHIES PIGMENTAIRES NON SYNDROMIQUES (RP) ET DU SYNDROME DE USHER (SU), LEQUEL REPRESENTE LA FORME LA PLUS COMMUNE DE RETINOPATHIE PIGMENTAIRE SYNDROMIQUE ASSOCIANT RP ET SURDITE. AVEC UNE PREVALENCE D'ENVIRON 1/4225 EN FRANCE, LA RP NON SYNDROMIQUE REPRESENTE LA CAUSE LA PLUS COMMUNE DE DEGENERESCENCE HEREDITAIRE DES PHOTORECEPTEURS. BIEN QUE 38 GENES AIENT ETE REPERTORIES POUR CETTE PATHOLOGIE MONOGENIQUE, LE DEFICIT MOLECULAIRE RESPONSABLE DE LA MALADIE EST INCONNU DANS LES 1/2 A 2/3 DES RP NON SYNDROMIQUES ET DANS 60% DES CAS DE SU, INDIQUANT QUE D'AUTRES GENES RESTENT A DECOUVRIR. DANS UN PREMIER TEMPS, NOUS AVONS ETABLI UN GROUPE DE PATIENTS ATTEINTS DE SU CHEZ LESQUELS NOUS N'AVONS PAS TROUVE DE MUTATIONS DANS TROIS DES GENES LES PLUS FREQUENTS DE CE SYNDROME. PUIS, AFIN DE SELECTIONNER DES GENES CANDIDATS, NOUS AVONS CARACTERISE UNE BANQUE DE SOUSTRACTION ENRICHIE EN MESSAGERS EXPRIMES DANS LA RETINE ET DANS LA COCHLEE ET NOUS AVONS EFFECTUE UNE RECHERCHE BIO-INFORMATIQUE DE GENES PRESENTANT CETTE DOUBLE SPECIFICITE. PLUSIEURS CLONES ET ESTs D'INTERET ONT ETE IDENTIFIES. AU COURS DE NOTRE RECHERCHE BIO-INFORMATIQUE, UN GENE, MYO3A, QUI ETAIT ALORS DECRIT COMME SPECIFIQUE DE LA RETINE, A ATTIRE NOTRE ATTENTION. NOUS AVONS MONTRE QUE L'ARN MESSAGER DE LA MYOSINE 3A CODEE PAR CE GENE EST AUSSI EXPRIME DANS LA COCHLEE, LE CERVEAU ET LE TESTICULE. NOUS AVONS, PAR IMMUNOHISTOCHIMIE, LOCALISE LA PROTEINE ENTRE LES SEGMENTS EXTERNES ET INTERNES DES PHOTORECEPTEURS DANS LA RETINE ET A L'EXTREMITE DES STEREOCILS DES CELLULES CILIEES DANS LA COCHLEE. LA FORTE EXPRESSION DE LA PROTEINE DANS LA RETINE ET LA COCHLEE, SON ROLE CENTRAL DANS LA VISION CHEZ LA DROSOPHILE, L'IMPORTANCE DES MYOSINES POUR L'AUDITION AINSI QU'UNE LOCALISATION CHROMOSOMIQUE SUR LE CHROMOSOME 10 QUI POUVAIT ETRE COMPATIBLE AVEC L'EXISTENCE D'UN LOCUS USHER ADDITIONNEL SUR CE CHROMOSOME SUGGERAIT QUE CE GENE ETAIT UN BON CANDIDAT POUR LE SYNDROME DE USHER. NOUS AVONS CRIBLE LES 35 EXONS DU GENE CHEZ 42 PATIENTS ATTEINTS DE SYNDROME DE USHER PAR SSCP ET SEQUENCAGE. UN VARIANT, Ala1032Thr, A ETE IDENTIFIE A L'ETAT HETEROZYGOTE CHEZ 3 PATIENTS ATTEINTS DE SU ; CE VARIANT ETAIT ABSENT DE 54 CONTROLES. SA PATHOGENICITE RESTE CEPENDANT INCERTAINE CAR NOUS N'AVONS PAS TROUVE DE MUTATIONS SUR LE SECOND ALLELE DU GENE. DANS UN SECOND TEMPS, NOUS AVONS DEVELOPPE UNE APPROCHE DE CARTOGRAPHIE DE GENES MORBIDES DANS 6 FAMILLES MEDITERRANEENNES. LES REGIONS CANDIDATES DECRITES DANS LA LITTERATURE ONT ETE EXCLUES POUR 5 D'ENTRE ELLES. UNE ANALYSE DU GENOME TOTAL A LA RESOLUTION DE 10 cM A ETE REALISEE AVEC LE CONCOURS DU CENTRE NATTIONAL DE GENOTYPAGE. NOUS AVONS AINSI IDENTIFIE 2 REGIONS HOMOZYGOTES : L'UNE DE 13 cM SUR LE CHROMOSOME 10 (10q24. 2) DANS UNE FAMILLE ET L'AUTRE DE 8 cM SUR LE CHROMOSOME 7 (7p22. 3) CHEZ UNE AUTRE FAMILLE. UN TOTAL DE 5 GENES CANDIDATS ONT ETE SEQUENCES DANS CES 2 FAMILLES SANS TROUVER DE MUTATIONS. LA SIXIEME FAMILLE, RECESSIVE, CORRESPOND AU LOCUS RP25 ; A L'AIDE DE MARQUEURS MICROSATELLITES ET DE SNP, NOUS AVONS REDUIT L'INTERVALLE DE LIAISON A DEUX REGIONS NON CONTIGUES, HOMOZYGOTES, DE 132 ET 151 kpb. EGFL11, UN GENE EXPRIME PREFERENTIELLEMENT DANS LA RETINE ET LOCALISE DANS CET INTERVALLE A ETE SEQUENCE SANS TROUVER DE MUTATIONS. UN NOUVEAU GENE DE CET INTERVALLE EST EN COURS DE SEQUENCAGE.


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  • Détails : 143 f.
  • Annexes : Bibliogr. f. 109-143

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