Vers un processus de sélection in vitro à deux dimensions qui combine le Selex et la chimie combinatoire dynamyque : application à la sélection d'aptamères conjugués dirigés contre l'élément TAR du VIH-1

par Anthony Bugaut

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et médicales. Biologie - Santé

Sous la direction de Bernard Rayner.

Soutenue en 2004

à Bordeaux 2 .


  • Résumé

    En dépit de leurs remarquables propriétés, les aptamères ADN ou ARN identifiés par SELEX souffrent également de certaines limitations. Aussi, des méthodes ont été développées afin d'introduire des modifications chimiques pour augmenter leur potentiel. Elles consistent soit à utiliser une banque d'oligonucléotides modifiés soit à incorporer des modifications par synthèse chimique après sélection. Cependant, dans le premier cas, la variété des modifications utilisables est fortement limitée par la capacité des enzymes à incorporer des nucléotides modifiés, et, dans le deuxième cas, les modifications doivent respecter la structure de l'aptamère. Pour dépasser ces limitations et permettre l'exploration d'une plus grande diversité moléculaire, nous avons développé un processus de sélection in vitro à deux dimensions qui combine la chimie combinatoire dynamique et le SELEX. Cette technique a été appliquée à la sélection d'aptamères conjugués dirigés contre l'élément TAR du VIH.

  • Titre traduit

    Toward o double-level in vitro selection process that combines Selex and dynamic combinatorial chemistry : application to the selection of conjugated aptamers directed against the TAR element of HIV


  • Résumé

    Despite their remarkable properties, DNA or RNA aptamers identified by SELEX also suffer from a number of limitations. Therefore, methods were developed to introduce chemical modifications that increase their potential. They consist in either using a library of modified oligonucleotides or incorporating modifications by chemical synthesis after selection. However, in the first case, the variety of the modifications usable is strongly limited by the capacity of the enzymes to incorporate modified nucleotides, and, in the second case, the modifications must respect the structure of the aptamer. To exceed these limitations and to allow the exploration of a greater molecular diversity, we developed double-level in vitro selection process which combines dynamic combinatorial chemistry and SELEX. This technique was applied to the selection of conjugated aptamers directed against the TAR element of the HIV.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (161 p.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. 234 réf.

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  • Bibliothèque : Université de Bordeaux. Direction de la Documentation. Bibliothèque des Sciences du Vivant et de la Santé.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : CMTB 2004-1118
  • Bibliothèque : Bibliothèque interuniversitaire de santé (Paris). Pôle pharmacie, biologie et cosmétologie.
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : MFTH 6098
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