Identification et caractérisation d'aptamères ARN bifonctionnels dirigés contre des structures ARN virales

par David Boucard

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et médicales. Biologie - Santé

Sous la direction de Carmelo Di Primo.

Soutenue en 2004

à Bordeaux 2 .


  • Résumé

    Les ARNs régulent de nombreuses fonctions biologiques par des interactions structurales, souvent impliquant plusieurs sites de fixation. Mimer ces interactions par des ligands ARN artificiels sructurés permettrait de moduler l'expression du génome d'agents pathogènes. Pour valider cette approche, nous avons développé un modèle de double complexe boucle-boucle ARN. Nous avons ainsi montré l'intérêt d'utiliser un double ligand structuré. Les régions non-codantes des ARNs du VIH-1 et du VHC présentent de nombreux motifs régulateurs essentiels pour ces virus. Deux stratégies furent utilisées pour cibler ces régions : l'une consistait à lier des ligands préalablement identifiés contre des motifs isolés, l'autre à effectuer une sélection in vitro contre une double tige-boucle régulatrice. Ainsi, nous avons identifié des ligands bifonctionnels impliquant une double interaction boucle-boucle qui présentaient une affinité et un effet inhibiteur accrus par rapport aux ligands simples.

  • Titre traduit

    Identification and Characterization of RNA Aptamers Targeting Viral RNA Structures


  • Résumé

    RNAs regulate numerous biological functions through intricate structural interactions that often involve several motifs. We could mimic these interactions with artificial structured RNA ligands to control the genomic expression of pathogenic agents. To validate this approach, we developped a model consisting in a double RNA loop-loop complex. Thus, we showed the benefit of using a double structured ligand. The non-coding regions of the genomes of HIV-1 and HCV exhibit numerous regulatory motifs crucial for these viruses. Two strategies were used to target these regions : the first one consisted in binding two ligands which were previously identified against isolated motifs ; the second was based on the SELEX procedure whose target was a regulatory double hairpin. Thus, we identified bifunctional ligand which involved a double loop-loop interaction and displayed an enhanced affinity and a better inhibitory effect compared with the monofunctional ligands.

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Informations

  • Détails : 1vol. (167 f.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. p. 159-167

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  • Bibliothèque : Université de Bordeaux. Direction de la Documentation. Bibliothèque des Sciences du Vivant et de la Santé.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : CMTB 2004-1097
  • Bibliothèque : Bibliothèque interuniversitaire de santé (Paris). Pôle pharmacie, biologie et cosmétologie.
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : MFTH 6138
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