Relations structure-fonction et propriétés de surface de protéines PR5 "thaumatin-like" de fruits comestibles

Structure-fonction relationships and surface properties of edible fruits PR-5 "thaumatin-like" proteins

• Auteur / Autrice : Laurence Menu-Bouaouiche
• Direction : Pierre Rougé
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie structurale
• Date : Soutenance en 2003
• Etablissement(s) : Toulouse 3

Mots clés

Mots clés contrôlés

Molécules

Antifongiques

Glucides

Thaumatines

Mots clés libres

Protéines thaumatin-like

Activité antifongique

Endo-β(1,3)glucanase

Fruits comestibles

Modélisation moléculaire

Résumé

Les protéines PR5 ou thaumatin-like (TLP) forment une famille structurale et phylogénique très homogène, mais elles possèdent in vitro des propriétés disparates : antifongiques, antigel, liaison et/ou hydrolyse de glucane. Certaines d'entre elles sont induites par des stress biotiques ou abiotiques et semblent intervenir dans la protection plus ou moins efficace des plantes vis à vis de pathogènes fongiques. D'autre part, certains fruits accumulent des protéines similaires au cours de leur maturation, dont celles de cerise et de pomme, allergéniques. Une meilleure connaissance des propriétés fonctionnelles et structurales des TLP spécifiques de fruits devrait permettre d'élaborer de nouveaux diagnostics d'allergènes et d'orienter, par rapport aux éventuels risques d'allergie, l'amélioration de la résistance naturelle des plantes. Afin de définir les relations structure-fonction de ces protéines, nous avons, tout d'abord, réalisé l'analyse de la phylogénie, de la structure et des propriétés électrostatiques et hydrophobes de surface de différents membres de la famille, par des techniques d'analyse de séquence et de modélisation moléculaire. . .

PR-5 or Thaumatin-like proteins (TLP) are structurally and phylogenetically related but their activities in vitro are very diverse: antifungal, antifreeze, glucan affinity and/or hydrolysis. Some of them are induced by biotic or abiotic stresses and could be involved in plant's defense against pathogenic fungi. In contrast, some fruits accumulate similar proteins during their maturation, like these of cherry or apple that are allergenic A better understanding of functional and structural properties of fruit specific's PR-5 proteins could allow new allergy diagnostics elaboration and new orientations' definition, beware of allergy risks, for natural plant defense amelioration. For the definition of TLP structure-function relationships, we have, first, analyzed different members of this family, for their phylogeny, their structure and their surface electrostatics and hydrophobic properties, by sequence analysis and molecular modeling methodologies. Thereafter, cherry, apple and banana's TLP and Thaumatin were compared for their enzymatic and antifungal activities. . .