Génomique de l'interaction entre le riz (Oryza sativa L. ) et le virus de la panachure jaune (Rice yellow mottle virus) : étude comparative de la réponse chez un cultivar sensible et un cultivar partiellement résistant

par Marjolaine Ventelon-Debout

Thèse de doctorat en Biologie végétale. Développement et adaptation des plantes

Sous la direction de Michel Delseny et de Christophe Brugidou.


  • Résumé

    Le RYMV (Rice yellow mottle virus) est responsable de la panachure jaune du riz, maladie affectant les rizières africaines. Oryza sativa regroupe deux groupes analogues à des sous-espèces : O. S. Indica, sensible au RYMV, et O. S. Japonica, plus résistant au RYMV. Notre étude concerne l'analyse des transcriptomes et protéomes de deux cultivars IR64 (O. S. Indica) sensible et Azucena (O. S. Japonica) partiellement résistant au RYMV. Les réponses des deux cultivars aux premiers stades de l'infection virale ont été caractérisées, mettant en évidence de nombreuses dérégulations de l'expression transcriptionnelle de gènes. Les catégories fonctionnelles telles que la photosynthèse, le métabolisme énergétique et les gènes de défense sont largement dérégulés au cours de l'infection, et des différences majeures entre les deux cultivars ont pu être identifiées.

  • Titre traduit

    Genomics of the interaction between rice (Oryza sativa L. ) and the Rice yellow mottle virus (RYMV). Comparative study of the response in a sensitive and a partially resistant cultivar


  • Résumé

    Rice Yellow Mottle Virus (RYMV) is one of the most damaging pathogens of rice (Oryza sativa) in Africa. O. Sativa comprises two groups of subspecies: O. S. Indica , very susceptible to RYMV infection and O. S. Japonica, partially resistant. Our project concerns the study of the transcriptome and the proteome of two varieties, a RYMV susceptible one (IR64, O. S. Indica) and a partially resistant one (Azucena, O. S. Japonica). Our main objectives are to identify and characterize the specific responses to RYMV of the two cultivars at the early stages of infection. Transcriptionnal expression is largely disturbed. Photosynthetic genes, metabolic genes and defense related genes are deregulated during RYMV infection specifically in each cultivar.

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Informations

  • Détails : 136 f.
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. p.105-124

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  • Bibliothèque : Université Perpignan Via Domitia. Service commun de la documentation. Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : TH 2003 VEN
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